Přehled publikační a vědecké činnosti

Články

• Caver Web 2.0: analysis of tunnels and ligand transport in dynamic ensembles of proteins

  MARQUES Sérgio Manuel BORKO Simeon VÁVRA Ondřej DVORSKÝ Jan KOHOUT Petr KABOUREK Petr HEJTMÁNEK Lukáš DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2025, ročník: 53, vydání: May 2025, DOI

• Commute Networks as a Signature of Urban Socioeconomic Performance: Evaluating Mobility Structures with Deep Learning Models

  KHULBE Devashish BELY Aliaksandr SOBOLEVSKIJ Stanislav

  Článek v odborném periodiku

  Smart Cities, rok: 2025, ročník: 8, vydání: 4, DOI

• Estimating resource budgets to ensure autotuning efficiency

  OĽHA Jaroslav HOZZOVÁ Jana ANTOL Matej FILIPOVIČ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  PARALLEL COMPUTING, rok: 2025, ročník: 123, vydání: March, DOI

• Genomic data sharing in research across Europe: legal challenges and upcoming opportunities within the European Health Data Space

  ROYO Romina GARCIA Eva SCHLÜNDER Irene HILMARSEN Christina KIELSHOLM THOMSEN Mette CAUËT Emilie KOK JENSEN Simon GIARDINA Simona HEBRANT Aline RAICEVIC TOUNGOUZ Gordana VAN DEN BULCKE Marc ARENAS Juan FYNBO CHRISTIANSEN Christian HOVIG Eivind HOLUB Petr VALENCIA Alfonso CAPELLA-GUTIERREZ Salvador

  Článek v odborném periodiku

  EUROPEAN JOURNAL OF PUBLIC HEALTH, rok: 2025, ročník: 35, vydání: Supplement_3, DOI

• GOLEM: A tool for visualizing the distribution of Gene regulatOry eLEMents within the plant promoters with a focus on male gametophyte

  NEVOSÁD Lukáš KLODOVÁ Božena RUDOLF Jiří RAČEK Tomáš PŘEROVSKÁ Tereza KUSOVÁ Alžbeta SVOBODOVÁ Radka HONYS David PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ Petra

  Článek v odborném periodiku

  Plant Journal, rok: 2025, ročník: 121, vydání: 5, DOI

• Gromacs MetaDump: a tool for extracting GROMACS simulation metadata

  ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2025, ročník: 17, vydání: 1, DOI

• How many (distinguishable) classes can we identify in single-particle analysis?

  LAUZIRIKA Oier PERNICA Martin HERREROS David RAMÍREZ-APORTELA Erney KRIEGER James GRAGERA Marcos ICETA Mikel CONESA Pablo FONSECA Yunior JIMÉNEZ Jorge FILIPOVIČ Jiří CARAZO Jose Maria SORZANO Carlos Oscar

  Článek v odborném periodiku

  ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D, rok: 2025, ročník: 81, vydání: 10, DOI

• Inhaled Lead Nanoparticles Enter the Brain through the Olfactory Pathway and Induce Neurodegenerative Changes Resembling Tauopathies

  JEDLIČKOVÁ Adriena KRISTEKOVÁ Daniela HUSÁKOVÁ Zuzana COUFALÍK Pavel VRLÍKOVÁ Lucie SMUTNÁ Tereza CAPANDOVÁ Michaela ALEXA Lukáš LUSKOVÁ Denisa KŘŮMAL Kamil JAKEŠOVÁ Veronika VEČEŘA Zbyněk ZEZULA Nikodém KANICKÝ Viktor HAMPL Aleš VACULOVIČ Tomáš MIKUŠKA Pavel DUMKOVÁ Jana BUCHTOVÁ Marcela

  Článek v odborném periodiku

  ACS Nano, rok: 2025, ročník: 19, vydání: 13, DOI

• Integration, Cataloguing and Management of Biobanking and Clinical Data Using FAIR Genomes Metadata Schema

  KACOVÁ Radoslava HOUFEK Tomáš HORKÝ Ondřej TOMÁŠIK Radovan KURÁŇ Jan RŮŽIČKA Michal HRSTKA Roman NOVÁČEK Vít DUDOVÁ Zdenka

  Článek v odborném periodiku

  Data Intelligence, rok: 2025, ročník: 2025, vydání: 1, DOI

• Joint-Dataset Learning and Cross-Consistent Regularization for Text-to-Motion Retrieval

  MESSINA Nicola SEDMIDUBSKÝ Jan FALCHI Fabrizio REBOK Tomáš

  Článek v odborném periodiku

  ACM Transactions on Multimedia Computing, Communications, and Applications, rok: 2025, DOI