RNDr. Terézia Slanináková

2025

• AlphaFind 2.0 – Enhanced structural similarity search for AlphaFold database

  SLANINÁKOVÁ Terézia ČILLÍK Jakub ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína KŘENEK Aleš PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka ANTOL Matej

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2025, druh: Další prezentace na konferencích

• GROMACS MetaDump

  ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Software

  Rok: 2025

• Gromacs MetaDump: a tool for extracting GROMACS simulation metadata

  ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2025, ročník: 17, vydání: 1, DOI

• Introducing a new adaptive look-up table subset selection method for leaf chlorophyll and carotenoids retrieval in broadleaved forests

  SLANINÁKOVÁ Terézia ŠVIK Marian REBOK Tomáš HANOUSEK Tomáš JANOUTOVÁ Růžena

  Článek v odborném periodiku

  Remote Sensing Letters, rok: 2025, ročník: 16, vydání: 6, DOI

• On the Costs and Benefits of Learned Indexing for Dynamic High-Dimensional Data

  SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav PROCHÁZKA David ANTOL Matej DOHNAL Vlastislav

  Článek ve sborníku

  Big Data Analytics and Knowledge Discovery 27th International Conference, DaWaK 2025, Bangkok, Thailand, August 25–27, 2025, Proceedings, rok: 2025

• On the Costs and Benefits of Learned Indexing for Dynamic High-Dimensional Data: Extended Version

  SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav PROCHÁZKA David ANTOL Matej DOHNAL Vlastislav

  Výzkumná zpráva

  Rok: 2025

• Refining Structure-Based Search in AlphaFold DB: Including confidence metrics into AlphaFind

  SLANINÁKOVÁ Terézia MARŠÁLKOVÁ Eva GREŠOVÁ Katarína KŘENEK Aleš OĽHA Jaroslav PAVLÍK Tomáš ŠPRINGEROVÁ Pavlína SEHNAL David ANTOL Matej

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2025, druh: Konferenční abstrakty

• Scaling Learned Metric Index to 100M Datasets

  PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia ČERŇANSKÝ Jozef OĽHA Jaroslav ANTOL Matej DOHNAL Vlastislav

  Článek ve sborníku

  SIMILARITY SEARCH AND APPLICATIONS, SISAP 2024, rok: 2025

2024

• 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze

• 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze