3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej
Rok publikování	2024
Druh	Projekty výzkumu a vývoje
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
Popis	The dataset contains proteins from AlphaFold DB v4 (https://alphafold.ebi.ac.uk/) encoded into one-dimensional vectors (embeddings). The embeddings encode proteins by their tertiary structure. Additional information is available at our GitHub (https://github.com/Coda-Research-Group/ProteinEmbeddingBenchmark).
Související projekty:	ELIXIR-CZ: Česká národní infrastruktura pro biologická data Naučené indexy pro podobností hledání Využití technik umělé inteligence pro zpracování dat, komplexní analýzy a vizualizaci rozsáhlých dat Nástroj na automatickou anotaci a prohledávání velkých sad proteinů na základě podobnosti jejich struktur