Mgr. Aleš Křenek, Ph.D.

2025

• SpecTUS: Spectral Translator for Unknown Structures annotation from EI-MS spectra

  HÁJEK Adam HECHT Helge PRICE Elliott James KŘENEK Aleš

  Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

  Rok: 2025, druh: Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný), DOI

2024

• Acceleration of Molecular Simulations by Parametric Time-Lagged tSNE Metadynamics

  HRADISKÁ Helena KUREČKA Martin BERÁNEK Jan TEDESCHI Guglielmo VIŠŇOVSKÝ Vladimír KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Recenzovaný odborný článek

  The Journal of Physical Chemistry B, rok: 2024, ročník: 128, vydání: 4, DOI

• Analysis of metadynamics simulations by metadynminer.py

  BERANEK Jan KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Recenzovaný odborný článek

  Bioinformatics, rok: 2024, ročník: 40, vydání: 10, DOI

• Beyond Metadata: Leveraging Similarity Search in Molecular Dynamics Data

  ROŠINEC Adrián PAVLÍK Tomáš SLANINÁKOVÁ Terézia KŘENEK Aleš ŠPRINGEROVÁ Pavlína ANTOL Matej SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty, DOI

• Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

  SLANINÁKOVÁ Terézia GREŠOVÁ Katarína PROCHÁZKA David SPIŠAKOVÁ Viktória ROŠINEC Adrián ČILLÍK Jakub ŠPRINGEROVÁ Pavlína KŘENEK Aleš DOHNAL Vlastislav SVOBODOVÁ Radka ANTOL Matej

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty, DOI

• Quantum Chemistry-Based Prediction of Electron Ionization Mass Spectra for Environmental Chemicals

  HECHT Helge ROJAS VERASTEGUI Wudmir Yudy AHMAD Zargham KŘENEK Aleš KLÁNOVÁ Jana PRICE Elliott James

  Recenzovaný odborný článek

  Analytical chemistry, rok: 2024, ročník: 96, vydání: 33, DOI

• Scientific Dataset Management System for the Research Institute Based on Onedata

  SVOBODA Tomáš ROŠINEC Adrián RAČEK Tomáš HANDL Josef KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty

2023

• A survey of the European Open Science Cloud services for expanding the capacity and capabilities of multidisciplinary scientific applications

  CALATRAVA Amanda ASOREY Hernán ASTALOS Jan AZEVEDO Alberto BENINCASA Francesco BLANQUER Ignacio BOBAK Martin BRASILEIRO Francisco CODÓ Laia CANO Laura del ESTEBAN Borja FERRET Meritxell HANDL Josef KERZENMACHER Tobias KOZLOV Valentin KŘENEK Aleš MARTINS Ricardo PAVESIO Manuel RUBIO-MONTERO Antonio Juan SÁNCHEZ-FERRERO Juan

  Recenzovaný odborný článek

  COMPUTER SCIENCE REVIEW, rok: 2023, ročník: 49, vydání: August, DOI

• Cloudification of scientific experimental data using Onedata

  SVOBODA Tomáš KŘENEK Aleš OPIOŁA Łukasz MANZI Andrea HANDL Josef

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management

  ROŠINEC Adrián SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích