Informace o projektu
Jak asymetrie lipidů ovlivňuje funkci proteinů
- Kód projektu
- GF25-19982L
- Období řešení
- 1/2025 - 12/2027
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- LA granty
- Partnerská agentura
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Universität Leipzig
- Odpovědná osoba Daniel Huster
- Odpovědná osoba Georg Pabst
Navzdory přirozené asymetrii eukaryotických a prokaryotických plazmatických membrán, které se vyznačují odlišným složením lipidů na obou jejich vrstvách, většina studií používá symetrické dvojvrstvy. Cílem tohoto projektu je vyplnit tuto mezeru pomocí synergické kombinace
molekulárně dynamických simulací, NMR spektroskopie a rozptylových technik, díky nimž objasníme strukturní a dynamické vlastnosti lipidů v asymetrických membránách se zaměřením na složení bakteriální lipidy a jejich interakce s integrálními membránovými proteiny. Určíme
parametry uspořádání lipidových řetězců, strukturu dvojvrstvy, dynamiku lipidů a interakci lipidů s proteiny, včetně lipidy indukovaných účinků na enzymatickou aktivitu dvou bakteriálních proteinů, OmpLA a GlpG, které reprezentují jak β-barrel, tak α-helikální transmembránové
proteiny. Tento projekt poskytne základní poznatky o roli lipidové asymetrie v biologických membránách a jejím vlivu na funkci membránových proteinů, což má potenciál ve farmaceutických a biotechnologických aplikacích, jako je vývoj terapeutik a biosenzorů zaměřených na lipidy.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 2
2025
-
gorder: Comprehensive tool for calculating lipid order parameters from molecular simulations
SoftwareX, rok: 2025, ročník: 31, vydání: September, DOI
-
gorder: Everything you will ever need for lipid order calculations
Rok: 2025