Project information
How lipid asymmetry influences membrane protein function
- Project Identification
- GF25-19982L
- Project Period
- 1/2025 - 12/2027
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- LA Grants
- Partner Agency
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
Universität Leipzig
- Responsible person Daniel Huster
- Responsible person Georg Pabst
Navzdory přirozené asymetrii eukaryotických a prokaryotických plazmatických membrán, které se vyznačují odlišným složením lipidů na obou jejich vrstvách, většina studií používá symetrické dvojvrstvy. Cílem tohoto projektu je vyplnit tuto mezeru pomocí synergické kombinace
molekulárně dynamických simulací, NMR spektroskopie a rozptylových technik, díky nimž objasníme strukturní a dynamické vlastnosti lipidů v asymetrických membránách se zaměřením na složení bakteriální lipidy a jejich interakce s integrálními membránovými proteiny. Určíme
parametry uspořádání lipidových řetězců, strukturu dvojvrstvy, dynamiku lipidů a interakci lipidů s proteiny, včetně lipidy indukovaných účinků na enzymatickou aktivitu dvou bakteriálních proteinů, OmpLA a GlpG, které reprezentují jak β-barrel, tak α-helikální transmembránové
proteiny. Tento projekt poskytne základní poznatky o roli lipidové asymetrie v biologických membránách a jejím vlivu na funkci membránových proteinů, což má potenciál ve farmaceutických a biotechnologických aplikacích, jako je vývoj terapeutik a biosenzorů zaměřených na lipidy.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 3
2025
-
gorder: Comprehensive tool for calculating lipid order parameters from molecular simulations
SoftwareX, year: 2025, volume: 31, edition: September, DOI
-
gorder: Everything you will ever need for lipid order calculations
Year: 2025
-
Martini 3 Limitations in Phospholipid Flip-Flop
Journal of Chemical Theory and Computation, year: 2025, volume: 21, edition: 19, DOI