Successor Sequence Predictor (SSP)

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	KHAN Rayyan Tariq KOHOUT Pavel MUSIL Miloš ROSÍNSKÁ Monika DAMBORSKÝ Jiří MAZURENKO Stanislav BEDNÁŘ David VILÍM Jan
Rok publikování	2024
Druh	Software
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
www	https://github.com/loschmidt/successor-sequence-predictor
Popis	Successor Sequence Predictor je "in silico" metoda, která napodobuje laboratorní evoluci proteinů tím, že rekonstruuje evoluční historii proteinu a navrhuje budoucí záměny aminokyselin na základě trendů pozorovaných v historii prostřednictvím pečlivě vybraných fyzikálně-chemických deskriptorů. Tento přístup vylepšuje specializované proteiny předpovídáním mutací, které zlepšují požadované vlastnosti, jako je termostabilita, aktivita a rozpustnost. Successor Sequence Predictor lze tedy použít jako obecný nástroj proteinového inženýrství k vývoji prakticky využitelných proteinů. Kód nástroje Successor Sequence Predictor je k dispozici na serveru GitHub https://github.com/loschmidt/successor-sequence-predictor.
Související projekty:	Stabilizace aplikačně atraktivních FGF proteinů pomocí pokročilých metod proteinového inženýrství