Informace o projektu
Vývoj modulární bioinformatické platformy pro analýzu dat získaných sekvenováním nové generace

Informace

Projekt nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka projektu je na webu muni.cz.

Kód projektu

TJ02000133

Období řešení

5/2019 - 4/2021

Investor / Programový rámec / typ projektu

Technologická agentura ČR

ZÉTA

Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Spolupracující organizace

HPST, s.r.o.

Odpovědná osoba RNDr. Zbyněk Halbhuber, Ph.D.
Odpovědná osoba Mgr. Tomáš Hron, Ph.D.

Our main goal is to establish a comprehensive NGS panel simultaneously analyzing gene mutations, copy number variations and antigen receptor rearrangements occurring in haematological malignancies and consequently to create a versatile bioinformatic tool for regular laboratory users. Using modern trends in user interface and user experience design, we aim to create an easy-to-use platform for routine application.

Publikace

Počet publikací: 11

2021

Bioinformatický nástroj pro zpracování NGS dat a uživatelské rozhraní - LYNX

REIGL Tomáš PORC Jakub Paweł PÁL Karol HYNŠT Jakub HRON Tomáš DARZENTAS Nikos NAVRKALOVÁ Veronika PLEVOVÁ Karla

Software

Rok: 2021
LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatic tool for integrative analysis of prognostic and predictive markers in B-cell malignancies.

NAVRKALOVÁ Veronika REIGL Tomáš PLEVOVÁ Karla HYNŠT Jakub PÁL Karol PORC Jakub Paweł MAREČKOVÁ Andrea JELÍNKOVÁ Hana DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
LYNX (Lymphoid next-generation sequencing): NGS panel a bioinformatický nástroj pro integrativní analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoproliferací.

NAVRKALOVÁ Veronika PLEVOVÁ Karla REIGL Tomáš HYNŠT Jakub PÁL Karol PORC Jakub Paweł MAREČKOVÁ Andrea JELÍNKOVÁ Hana JANÍKOVÁ Andrea DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty
LYNX: an interactive bioinformatic tool for capture-based next-generation sequencing data analysis in lymphoid malignancies.

REIGL Tomáš NAVRKALOVÁ Veronika HYNŠT Jakub PORC Jakub Paweł PÁL Karol HRON Tomáš DARZENTAS Nikos POSPÍŠILOVÁ Šárka HALBHUBER Z. PLEVOVÁ Karla

Konferenční abstrakty

Rok: 2021, druh: Konferenční abstrakty

2020

Capture-based NGS panel for detection of immunoglobulin and T-cell receptor gene rearrangements in DNA samples from patients with acute lymphoblastic leukemia

JELÍNKOVÁ Hana NAVRKALOVÁ Veronika PLEVOVÁ Karla PORC Jakub Paweł HYNŠT Jakub PÁL Karol REIGL Tomáš DARZENTAS Nikos DOUBEK Michael ŽENATOVÁ Marcela MAREČKOVÁ Andrea POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
High throughput sequencing data analysis of IG/TR rearranged genes in leukemie clinical research.

REIGL Tomáš PORC Jakub Paweł STRÁNSKÁ Kamila PÁL Karol NAVRKALOVÁ Veronika HYNŠT Jakub BYSTRÝ Vojtěch POSPÍŠILOVÁ Šárka DARZENTAS Nikos PLEVOVÁ Karla

Konferenční abstrakty

Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
LYNX – modulární bioinformatický nástroj s uživatelským rozhraním pro analýzu NGS da u pacientů s hematologickými malignitami

REIGL Tomáš NAVRKALOVÁ Veronika HYNŠT Jakub PORC Jakub Paweł PÁL Karol HRON T. HALBHUBER Z. POSPÍŠILOVÁ Šárka DARZENTAS Nikos PLEVOVÁ Karla

Konferenční abstrakty

Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
LYNX (Lymphoid NGS): a versatile NGS panel for comprehensive analysis of molecular markers with clinical relevance in lymphoproliferative disorders

NAVRKALOVÁ Veronika HYNŠT Jakub PLEVOVÁ Karla PÁL Karol REIGL Tomáš PORC Jakub Paweł DARZENTAS Nikos MAREČKOVÁ Andrea JELÍNKOVÁ Hana ŽENATOVÁ Marcela PAVLOVÁ Šárka KOTAŠKOVÁ Jana POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty
LYNX (Lymphoid NGS): Komplexní NGS panel pro analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lympfoproliferací

NAVRKALOVÁ Veronika HYNŠT Jakub PÁL Karol PLEVOVÁ Karla REIGL Tomáš DARZENTAS Nikos MAREČKOVÁ Andrea JELÍNKOVÁ H. POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2020, druh: Konferenční abstrakty

2019

LYNX (Lymphoid NGS): Komplexní NGS panel pro analýzu prognostických a prediktivních markerů B-buněčných lymfoprolyferací.

NAVRKALOVÁ Veronika HYNŠT Jakub PÁL Karol PLEVOVÁ Karla REIGL Tomáš DARZENTAS Nikos ŽENATOVÁ Marcela MAREČKOVÁ Andrea JELÍNKOVÁ Hana POSPÍŠILOVÁ Šárka

Konferenční abstrakty

Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty