Quantification of retrotransposons in Eleocharis using degenerate real-time PCR

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Kvantifikace retrotranspozonů v rodě Eleocharis pomocí degenerované real-time PCR
Autoři	ZEDEK František ROTREKLOVÁ Olga HOROVÁ Lucie ŠMERDA Jakub BUREŠ Petr
Rok publikování	2009
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Popis	Rod Eleocharis (Cyperaceae) zahrnuje asi 200 druhů. Z karyologického hlediska má Eleocharis mezi ostatními rostlinami unikátní postavení. Zástupci rodu Eleocharis se významě liší ve velikostech genomu (od 0,42 pg u Eleocharis cellulosa do 9 pg u E. uniglumis subsp. sterneri) a průměrných velikostech chromozómů (od asi 2 Mbp u E. cellulosa fo 299 Mbp u E. xyridiformis). Velikost genomu a průměrná velikost chromozómů vzrůstá s fylogenetickou odvozeností druhů rodu Eleoharis. Tato studie se zaměřuje na roli retrotranspozonů v tomto trendu.
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase Centrum pro výzkum biodiverzity