Molecular and cytogenetic analysis of the biggest plant genomes
| Název česky | Molekulární a cytogenetická analýza největších rostlinných genomů |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2009 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Rod Fritillaria obsahuje druhy s největším doposud známým genomem a zároveň poskytuje obrovskou vnitrodruhovou variabilitu týkající se velikosti genomu (30,000-127,000 Mb/C) spolu s až překvapivou uniformitou karyotypu. Tento rod je znám bikontinentální distribucí a obě větve ukazují nezávislou tendenci zvětšovat velikost genomu. Ze satelitních sekvencí jsme popsali velmi nehomogenní AT-bohatou satelitní repetitivní sekvenci reprezentující významnou část heterochromatinových oblastí na chromozomech u druhů severoamerických, ale nevyskytující se u eurasijských druhů rodu Fritillaria. Abychom byli schopni identifikovat také rozptýlené repetitivní elementy, bylo sekvenováno a následně charakterizováno přes 140 kb od jednoho druhu z každé větve (s přibližně podobnou velikostí genomu): Fritillaria imperialis (Eurasie) a F. affinis (Severní Amerika). Prozatím jsme pozorovali, že procentuální podíl různých tříd repetitivních elementů se mezi danými modelovými druhy významně neliší a zároveň byly jako dominantní elementy genomů modeových druhů rodu Fritillaria identifikovány retrotranspozony typu Ty3/gypsy. |
| Související projekty: |