Molekulární detekce syfilis: PCR diagnostika, typizace a detekce makrolidové rezistence u Treponema pallidum.
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2010 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Bakterii Treponema pallidum nelze kultivovat v podmínkách in vitro a proto nelze aplikovat klasický přístup pro určení rezistence k antibiotikům. Primární detekce genetického materiálu T. pallidum u klinických vzorků zahrnovala dvoukrokovou PCR dvou nezávislých treponemálních lokusů (polA = TP0105 a tmpC = TP0319). U pozitivních vzorků byly opět dvoukrokovým PCR protokolem amplifikovány sekvenčně variabilní úseky hypotetických genů TP0136 a TP0548 a lokus 23S rDNA. Amplikony hypotetických genů byly sekvencovány dideoxynukleotidterminátorovou metodou s pomocí původních amplifikačních a interních sekvenačních primerů. Amplikon 23S rDNA byl podroben restrikčnímu testu Mbo II/Bsa I s cílem zjistit přítomnost mutací A2058G a A2059G podmiňujících rezistenci k makrolidům. Zavedli jsme nový typovací systém s diskriminační schopností 8 subtypů u vzorků od 32 pacientů. Získané výsledky dále naznačují, že geneticky kódovaná rezistence k makrolidům je u syfilis v České republice relativně častá (36,4 %). |
| Související projekty: |
|