Single Stranded Loops of Quadruplex DNA As Key Benchmark for Testing Nucleic Acids Force Fields

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Jednořetězcové smyčky DNA kvadruplexů jako klíčový benchmark pro testování silových polí pro nukleové kyseliny
Autoři	FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda JOANNA Sarzynska KOČA Jaroslav OROZCO Modesto CHEATHAM Thomas KULINSKI Tadeusz SPONER Jiri
Rok publikování	2009
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Journal of Chemical Theory and Computation
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	DNA quadruplex; MD simulation; force fields
Popis	Provedli jsme sadu explicitních molekulové dynamických simulací na dvou molekulách DNA kvadruplexu (G-DNA). Hlavním cílem práce bylo testovat schopnost molekulově dynamických technik popsat jednořetězcové topologie G-DNA smyček, které reprezentují velmi náročnou úlohu pro počítačové metody.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Biomolekulární centrum