Balance of Attraction and Repulsion in Nucleic Acid Base Stacking: CCSD(T)/Complete Basis Set Limit Calculations on Uracil Dimer and a Comparison with the Force Field Description

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Rovnováha přitahování a odpuzování při stackingu bází nukleových kyselin: CSSD(T)/Kompletní basis limit set výpočty dimerů uracilu a srovnání s popisem pomocí silového pole
Autoři	MORGADO Claudio JUREČKA Petr SVOZIL Daniel HOBZA Pavel ŠPONER Jiří
Rok publikování	2009
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Journal of Chemical Theory and Computation
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	quantum chemical calculations; nucleic acids; force field
Popis	Provedli jsme referenční kvantově-chemické výpočty pro 100 geometrií dimerů uracilu v stacking konformacích. Výpočty byly provedeny na geometriích s neoptimalizovanými vzdálenostmi mezi monomery. Kromě kvantově-chemických výpočtů jsme provedli výpočty i pomocí molekulové mechaniky.
Související projekty:	Biomolekulární centrum