Generation of Digital Phantoms of Cell Nuclei and Simulation of Image Formation in 3D Image Cytometry

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Generování digitálních fantomů buněčných jader a simulace tvorby obrazu v 3D obrazové cytometrii
Autoři	SVOBODA David KOZUBEK Michal STEJSKAL Stanislav
Rok publikování	2009
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Cytometry Part A
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
Doi	http://dx.doi.org/10.1002/cyto.a.20714
Obor	Využití počítačů, robotika a její aplikace
Klíčová slova	digital phantom; synthetic image; procedural texture; point spread function; fluorescence optical microscope; 3D image cytometry
Popis	V obrazové cytometrii se denně setkáváme s problémem kvality snímků buněk a zejména s problémem kvality analyzačních metod. Jedním ze způsobů měření kvality těchto metod je využití tzv. fantomů. V tomto článku je popsán postup, jakým způsobem vygenerovat digiální fantomy pro specifické druhy biomedicínských dat. Dále se zde také popsána simulace průchodu obrazu takového fantomu optickou soustavou a simulace snímání. Celkově je zde definován popis, jakým způsobem je možné generovat umělá obrazová data. Součástí textu je také měření kvality takto vygenerovaných dat a jejich srovnání s původními realnými obrazovými daty.
Související projekty:	Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu v normě a patologii Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů