Combination of mRNA and protein microarray analysis in complex cell profiling

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Kombinace mRNA a proteinové microarray analýzy v komplexním profilování buněk
Autoři	ŠIMARA Pavel KOUTNÁ Irena STEJSKAL Stanislav KRONTORÁD Petr RUČKA Zdeněk PETERKOVÁ Martina KOZUBEK Michal
Rok publikování	2009
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Neoplasma
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
www	Odborný vědecký článek
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	microarray; cell profiling; protein expression; mRNA expression; HL-60
Popis	Tato studie kombinuje mRNA a proteinovou analýzu za využití cDNA microarrays a protilátkových microarrays. Integrací těchto dvou technologií získáváme komplexní pohled na buněčný molekulární profil. Studie byla provedena na leukemické buněčné linii HL-60, která diferencovala do granulocytárního stádia po přidání kyseliny retinové (ATRA). Tato buněčná linie tedy slouží jako in-vitro model hematopoezy. Pozorovali jsme změnu hladiny určitých proteinů, účastnících se zejména diferenciačních a apoptických signálních drah, často s onkogenetickým potenciálem. Hladina mRNA vždy neodpovídala hladině exprimovaného proteinu.
Související projekty:	Vytipování markerů, screening a časná diagnostika nádorových onemocnění pomocí vysoce automatizovaného zpracování multidimenzionálních biomedicínských obrazů Funkční a molekulární charakteristiky nádorových a normálních kmenových buněk - identifikace cílů pro nová terapeutika a terapeutické strategie