Effect of Counter Ions on Cross-Correlated Relaxation Rates in Nucleic Acids

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Vliv protiiontů na kroskorelované relaxační rychlosti v nukleových kyselinách
Autoři	TRANTÍREK Lukáš SKLENÁŘ Vladimír FIALA Radovan
Rok publikování	2008
Druh	Článek ve sborníku
Konference	XXIII International Conference on Magnetic Resonance in Biological Systems
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	NMR; nucleic acids;structure;dynamics
Popis	Studium struktury a dynamiky biomolekul založené na NMR relaxačních rychlostech a indukovaných chemických posunech všeobecně předpokládá, že tenzory chemického stínění jsou pro daný typ atomu konstantní a nezávislé na experimentálních podmínkách. Ověřovali jsme platnost tohoto předpokladu pro různé typy a koncentrace protiiontů u mimořádně stabilní DNA smyčky d(GCGAAGC) pomocí měření kroskorelovaných relaxačních rachlostí mezi CSA C-13 a dipolární interakcí H1-C13 u protonovaných uhlíků v bázích. Výsledky ukazují, že typ protiiontu významně ovlivňuje velikost a orientaci tenzoru chemického stínění C-13 v bázích. Fyzikálně správná interpretace NMR parametrů závisejících na velikosti nebo orientaci tenzoru chemického stínění by proto měla brát v úvahu složení pufru.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Biomolekulární centrum