Prediction of tryptic peptide retention times by means of soft modelling as a tool for liquid chromatography-mass spectrometry driven proteomics

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Předpověď retenčních časů tryptických peptidů pomocí tzv. měkkého modelování jako nástroj pro proteomiku vedenou kapalinovou chromatografií a hmotnostní spektrometrií
Autoři	HAVLIŠ Jan MONINCOVÁ Lenka
Rok publikování	2007
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	Trends in Chromatography
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Analytická chemie, separace
Klíčová slova	retention time;prediction;proteomics;tryptic peptides;liquid chromatography;mass spectrometry
Popis	Předpověď retenčních časů tryptických peptidů může významně sloužit v proteomice podporované LC-MS ke zkvalitnění identifikace proteinů pomocí de novo sekvenování využitím informace o retenčním čase, jež je též závislý na sekvenci. Tento přehledný článek shrnuje současný stav poznatků na tomto poli se zvláštním zřetelem k využití umělých neuronových sítí.
Související projekty:	Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací