Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2008 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Rod Treponema zahrnuje zástupce s různou mírou invazivity a patogenity. T. pallidum subsp. pallidum je etiologickým agens sexuálně přenosné syfilis a je obligátním patogenem člověka. Endemické nevenerické treponemální infekce tropických a subtropických oblastí vyvolávají T. pallidum subsp. pertenue (způsobující yaws) a T. pallidum subsp. endemicum (způsobující endemickou syfilis). Blízce příbuzný druh T. paraluiscuniculi způsobuje venerické onemocnění králíků a není infekční pro člověka. Genomy 9 zástupců zahrnující kmeny Mexico A, Street strain 14, DAL-1 (T. p. pallidum), Samoa D, Gauthier, CDC-2 (T. p. pertenue), Bosnia A (T. p. endemicum), Fribourg-Blanc (taxonomicky blíže nespecifikovaný opičí izolát) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi) byly porovnány pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) s genomem kmene Nichols (T. p. pallidum), jehož komletní nukleotidová sekvence je známa. Získané restrikční profily byly použity k determinaci heterologních úseků DNA jednotlivých treponemálních kmenů. U kmenů Mexico A, DAL-1, Gauthier, CDC-2, Fribourg-Blanc bylo zatím analyzováno 71 % genomu, u kmene Bosnia A 46 %. |
| Související projekty: |
|