Využití metody ARDRA pro druhovou identifikaci nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	KŠICOVÁ Kateřina ŠPANOVÁ Alena RITTICH Bohuslav
Rok publikování	2007
Druh	Článek ve sborníku
Konference	XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Genetika a molekulární biologie
Klíčová slova	Bifidobacterium; ARDRA; identification
Popis	Pomocí ARDRA analýzy identifikovat bakteriální kmeny isolované z humánních zdrojů, které byly rodově specifickou PCR zařazeny do rodu Bifidobacterium a které při použití druhově specifických PCR vykazovaly zkřížené reakce a proto nemohly být zařazeny do druhů. Restrikční analýza amplikonu 914bp pomocí restriktáz AluI a Sau3 AI umožnila odlišení druhů B .adolescentis, B. bifidum, B. breve, B. catenulatum, B. infantis a B. longum. Celkem bylo rozlišeno a zařazeno do druhů deset z jedenácti nově isolovaných kmenů. Lze konstatovat, že ARDRA analýza je rychlá a reprodukovatelná identifikační metoda s vysokým diskriminačním potenciálem na úrovni druhu.
Související projekty:	Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů bakterií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin