Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Lékařskou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	ČEJKOVÁ Darina ŠMAJS David
Rok publikování	2005
Druh	Konferenční abstrakty
Fakulta / Pracoviště MU	Lékařská fakulta
Citace
Popis	Spirocheta T pallidum ssp. pallidum, původce syfilis, je obligátní lidský patogen. Tuto treponemu nelze kultivovat v podmínkách in vitro. Sekvenace genomu a následná konstrukce BAC knihovny v E. coli otevřely nové možnosti výzkumu T. pallidum (např. studium regulace transkripce). Studium regulátorů jsme prováděli v klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Geny rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující aktivátor transkripce) byly naklonovány do expresních, arabinózou indukovatelných, plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy. Metodou Q-PCR jsme vyšetřili expresi vybraných treponemálních genů po indukci exprese genů rpoN a fhlA. 54 závislé promotory jsme identifikovali analýzou in silico a předpovězené transkripty následně mapovali pomocí PCR z cDNA. Proteiny RpoN a FhlA jsou tedy pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci několika treponemálních genů.
Související projekty:	Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací