Parallelization of the Programme CICADA

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Paralelizace programu CICADA
Autoři	KOSINA Aleš ČERNOHORSKÝ Martin KŘÍŽ Zdeněk
Rok publikování	2004
Druh	Článek ve sborníku
Konference	14th Summer School on Computing Techuniques in Physics: Cluster for Computing in Physics
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biochemie
Klíčová slova	Parallelization; Single Coordinate Driving; Conformational Analysis; Grid
Popis	Program CICADA je postaven na SCD (Single Coordinate Driving) přístupu a je používán pro konformační analýzu malých a středních molekula a pro molekulární docking. Program CICADA byl paralelizován pomocí Master-Slave přístupu. Výsledky ukazují velmi dobrou škálovatelnost i na malých molekulách a několika málo rotovatelnými torzemi. Program může řešit ulohy většího rozsahu než dokázala sekvenční verze.
Související projekty:	Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu