Evaluation of (GTG)5-PCR for identification of Enterococcus spp.

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Využití (GTG)5-PCR pro identifikaci Enterococcus spp.
Autoři	ŠVEC Pavel VANCANNEYT Marc SEMAN Milan SNAUWAERT Cindy LEFEBVRE Karen SEDLÁČEK Ivo SWINGS Jean
Rok publikování	2005
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	FEMS Microbiology Letters
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Mikrobiologie, virologie
Klíčová slova	Enterococcus; rep-PCR; (GTG)5-PCR; identification; bryndza; water
Popis	Skupina referenčních a neidentifikovaných kmenů enterokoků byla analyzována rep-PCR s (GTG)5 primerem pro zjištění rozlišovaní schopnosti a vhodnosti této metody pro typizaci a identifikaci druhů enterokoků. Celkem 49 kmenů reprezentujících všechny doposud popsané druhy enterokoků bylo získáno z bakteriálních sbírek. Pro spolehlivější ověření tohoto identifikačního přístupu bylo dále testováno 112 dobře charakterizovaných enterokoků izolovaných z bryndzy. Výsledky (GTG)5-PCR zařadily všechny kmeny do jasně oddělených skupin reprezentujících jednotlivé druhy. Následně byla metoda použita pro identifikaci 44 blíže neurčených kmenů enterokoků izolovaných z povrchových vod. Získané výsledky jasně zařadily tyto kmeny do jednotlivých druhů. Tato studie prokázala, že rep-PCR s (GTG)5 primerem je vhodná a rychlá metoda pro druhovou identifikaci enterokoků.
Související projekty:	Diverzita biotických společenstev: kauzální analýza variability v prostoru a čase