Complexity and Convergence of Electrostatic and van der Waals Energies within PME and Cutoff Methods

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Fakultu informatiky. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Složitost a konvergence výpočtu energie elektrostatických a van der Waalsovských interakcí prostřednictvím PME a cutoff metod
Autoři	SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav ZHAN Chang-Guo
Rok publikování	2004
Druh	Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj	International Journal of Molecular Sciences
Fakulta / Pracoviště MU	Fakulta informatiky
Citace
www	http://www.mdpi.org/ijms/papers/i5040154.pdf
Obor	Fyzikální chemie a teoretická chemie
Klíčová slova	Van der Waals energy; electrostatic energy; convergence of energy; PME
Popis	V článku byla studována výpočetní složitost a konvergence PME a cutoff metod, sloužících pro výpočet energie elektrostatických a van der Waalsovských interakcí. Z výsledků analýz jsme učinili následující závěry: Volba vhodné metody záleží na typu molekuly. Pro nukleové kyseliny byla vhodnější metoda PME, pro proteiny cutoff metody, v případě oligosacharidů je možno použít obě metody.
Související projekty:	Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu