NMR Distance Restraints At Low Temperatures : An Application to DNA Hairpin.

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Název česky	Extrakce NMR dat s využitím nízkoteplotních měření : Aplikace metody pro DNA hairpin.
Autoři	MATEJKOVÁ Michaela PADRTA Petr FIALA Radovan SKLENÁŘ Vladimír
Rok publikování	2004
Druh	Článek ve sborníku
Konference	19th NMR Valtice : Central European NMR Discussion Groups
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biochemie
Klíčová slova	NMR;DNA;structure
Popis	Krátké DNA oligonukleotidy hrají významnou úlohu v mnohých biologických procesech. Nejzajímavějsí vlastností hairpinů s obecnou sekvencí d(GCGNAGC) (N=A,G,C,T) je jejich výjimečná stabilita, reprezentovaná vysokou teplotou tání hairpinů, jejich zvýšenou mobilitou u PAGE elektroforézy a odolností vůči nukleázám. Proto poznáním a studiem jejich struktur můžeme lépe porozumět i jejich výjimečnému chování. Struktura jednoho z těchto oligonukleotidů, d(GCGAAGC), byla nedávno vyřešena pomocí NMR spektroskopie s využitím meziprotonových vzdáleností získaných z NOESY spekter, torzních úhlů i zbytkových dipolárních interakcí. Cílem teto studie byl výpočet struktury zmíněného hairpinu d(GCGAAGC) s využitím dat získaných z NOESY spekter, změřených při teplotě pod 273K. Při této teplotě dochází k potlačení chemické výměny i intramolekulárních pohybů, čímž lze získat více dat potrebných pro následné řešení struktury molekuly.
Související projekty:	Biomolekulární centrum