Computer modelling of DNA quadruplex conformational behavior

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Přírodovědeckou fakultu. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	FADRNÁ Eva ŠPAČKOVÁ Naděžda ŠPONER Jiří KOČA Jaroslav
Rok publikování	2002
Druh	Článek ve sborníku
Konference	Chemické Listy
Fakulta / Pracoviště MU	Přírodovědecká fakulta
Citace
Obor	Biofyzika
Klíčová slova	structure; dynamics; nucleic acids
Popis	Advanced methods of molecular modelling have been applied on the DNA quadruplexes. We have investigated an antiparallel DNA quadruplex formed by a dimerization of dGGGGTTTTGGGG with a four-tetrad stem and two lateral four-thymidine loop. A long scale molecular dynamics (MD) has been applied together with a post processing analysis including the study of solvation, interactions with ions, the free energy contribution and the entropy analysis.
Související projekty:	Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu