GROMACS MetaDump

Varování

Publikace nespadá pod Ústav výpočetní techniky, ale pod Středoevropský technologický institut. Oficiální stránka publikace je na webu muni.cz.

Autoři	ROŠINEC Adrián SLANINÁKOVÁ Terézia PAVLÍK Tomáš RANDIAK Róbert SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš BUČEKOVÁ Gabriela SCHINDLER Ondřej ANTOL Matej KŘENEK Aleš BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka
Rok publikování	2025
Druh	Software
Fakulta / Pracoviště MU	Středoevropský technologický institut
www	GitHub GROMACS MetaDump - homepage
Popis	Software Gromacs MetaDump slouží k automatickému vytváření FAIR metadat pro biomolekulární simulační data získaná programem GROMACS. Umožňuje extrakci informací z TPR souborů, jejich validaci, úpravu a export metadat ve formátu JSON nebo YAML. Nástroj je volně dostupný bez nutnosti registrace prostřednictvím webového rozhraní (https://gmd.ceitec.cz/), API nebo Python skriptu v Docker kontejneru.
Související projekty:	Česká národní infrastruktura pro biologická data