 |
Závěrečná zpráva o řešení výzkumného záměru
| Identifikační kód |
MSM 143300004 |
| Název výzkumného záměru |
Digitální knihovny |
| Příjemce |
Masarykova univerzita v Brně |
| Vykonavatel |
Ústav výpočetní techniky MU |
| Řešitel |
Miroslav Bartošek |
| Doba řešení |
1. 1. 1999 - 31. 12. 2004 |
Obsah
- Předpokládané cíle řešení výzkumného záměru
- Dosažené cíle a uplatněné výsledky
- Nejvýznamnější výsledky řešení výzkumného záměru
- Náklady na řešení výzkumného záměru
- Čerpání finančních prostředků v roce 2004
1. Předpokládané cíle řešení výzkumného záměru
| 1.1. |
Cíle řešení výzkumného záměru v letech 1999-2003, strategie jejich
dosažení a předpokládané výsledky |
a) Cíle výzkumného záměru (z návrhu VZ v r.1998)
Náplní výzkumného záměru je oblast Digitální knihoven (Digital Libraries - DL)
jako kritické složky nově vznikajících systémů distribuovaného znalostního prostředí
(Distributed Knowledge Environments), umožňujících universální přístup prakticky
ke všem oblastem lidského vědění. Výzkum se zaměří do vybraných oblastí problematiky
digitálních knihoven rozvíjených na ÚVT MU, tvořících součást informační
infrastruktury DL, resp. DL-middleware: zpracování a zpřístupnění dat v heterogenních
distribuovaných zdrojích, bezpečnostní protokoly/mechanismy přenosu dat po veřejné
počítačové síti, kvalita síťových služeb v metropolitních sítích.
Cílem předkládaného záměru je výzkum včetně vytváření podmínek pro uplatňování
progresivních postupů a technologií v následujících vybraných oblastech souvisejících
s řešením obecné problematiky digitálních knihoven:
| |
a) |
zpracování a zpřístupnění informací v heterogenních distribuovaných zdrojích, včetně
oblasti inteligentního uživatelského přístupu; |
| b) |
bezpečnostní protokoly a mechanismy zpřístupnění a přenosu citlivých informací
v prostředí veřejné počítačové sítě; |
| c) |
některé aspekty zajištění kvality síťových služeb pro potřeby digitálních knihoven
(dostupnost, přenos, rychlost odezvy). |
| Ad A) |
Zpracování a zpřístupnění informací v heterogenních distribuovaných zdrojích |
Výzkumný záměr v této oblasti se dotýká zejména následujících oblastí informačních
technologií: koncepce digitálních knihoven; metadata a metainformace; interoperabilita;
sběr dat uložených v nezávislých distribuovaných zdrojích; distribuce integrovaných
dat do nezávislých lokálních systémů; zpřístupňování dat různým skupinám oprávněných
uživatelů; vstup dat do integrovaného systému; hypermediální uživatelské rozhraní.
Cíle:
- definovat koncepci jednotné integrované digitální knihovny
- navrhnout systém pro popis a klasifikaci informačního objektu využitelný pro
automatizované zpracování (metadata)
- analyzovat podmínky pro integraci a kooperaci různorodých informačních zdrojů v rámci
jednotné digitální knihovny (interoperabilita)
- zkoumat aktuální aspekty integrace digitální a klasické knihovny
- definovat rozhraní mezi zdroji dat (dílčími informačními systémy) a integrovaným systémem
- zprůchodnit obousměrný přenos informací přes tato rozhraní
- umožnit uživatelům digitální knihovny snadný, komfortní a pružný přístup k informacím,
které je zajímají resp. které se právě jich týkají
- umožnit oprávněným uživatelům modifikovat data v digitální knihovně
- návrh speciálního hypermediálního dokumentu pro přístup k multimediálním informacím
| Ad B) |
Bezpečnostní protokoly a mechanismy zpřístupnění a přenosu citlivých informací
v prostředí veřejné počítačové sítě |
Výzkumný záměr v této oblasti se dotýká zejména následujících oblastí informačních
technologií: kryptografie a bezpečnost informačních technologií; počítačové sítě
a komunikační protokoly.
Cíle:
- navrhnout podmínky pro vytvoření jednotného decentralizovaného systému
identifikace a autentizace jednotlivých subjektů vstupujících do procesu
ukládání, získávání a přenosu dat v prostředí digitální knihovny na veřejné
počítačové síti
- navrhnout možnosti zabezpečení přenosu dat na síťové úrovni, jak při spolupráci
koncových systémů, tak využitím směrovačů. Tato část se týká zejména budování
rozsáhlých virtuálních privátních sítí a implementace bezpečnostního protokolu Ipsec
- zajistit ochranu dat koncových uživatelů. Vypracovat systém distribuované
certifikační autority a serveru veřejných klíčů všech uživatelů sítě
v rámci digitální knihovny
| Ad C) |
Některé aspekty zajištění kvality síťových služeb pro potřeby digitálních knihoven |
Výzkumný záměr v této části se týká zejména problematiky kvality služeb počítačové sítě.
Cíle:
- výzkum podmínek a možností zajištění dostupnosti dat v reálném čase. Aplikace
existující technologie pro QoS v procesu přenosu dat citlivých na přenosové
parametry počítačové sítě dle požadavků digitálních knihoven
- zkoumání možností přechodu počítačové sítě na nové verze přenosových protokolů
schopných zajistit kvalitativně vyšší standard přenosu dat
- zkoumání podmínek bezpečného uchovávání a efektivní distribuce velkoobjemových
dat digitální knihovny v prostředí rozlehlé vysokorychlostní sítě
b) Předpokládané výsledky (z návrhu VZ v r. 1998)
Předpokládané výsledky jsou dvojího charakteru: jednak články v časopisech a sbornících
odborných konferencí, jednak prototypová aplikační řešení v jednotlivých oblastech
výzkumného záměru a pořádání tématických workshopů s mezinárodní účastí na jednotlivé
témata výzkumného záměru.
V oblasti "zpracování a zpřístupnění informací v heterogenních distribuovaných
zdrojích" bude v první fázi probíhat základní sledovatelský výzkum a analýza
obecných podmínek pro integraci a kooperaci heterogenních informačních zdrojů.
V roce 2000 budou zahájeny práce na definování rozhraní mezi zdroji dat a na
návrhu speciálního hypermediálního dokumentu pro přístup k multimediálním informacím.
V další etapě budou ověřovány získané poznatky při vývoji prototypového systému pro
integraci a zpřístupnění obrazových informačních zdrojů produkovaných diagnostickými
zařízeními v oblasti medicíny a při začleňování zárodků digitálních knihoven do
integrovaného informačního systému.
V oblasti "bezpečnostní protokoly a mechanismy zpřístupnění a přenosu citlivých
informací v prostředí veřejné počítačové sítě" budou v rámci první etapy analyzovány
možnosti využití standardů v oblasti identifikace, autentizace a autorizace;
následně dojde k rozpracování koncepce jednotného identifikačního-autentizačního-autorizačního
distribuovaného systému v podmínkách metropolitní počítačové sítě a pořízení prototypových serverů.
V roce 2000 bude zahájena implementace uvedeného systému a bude zahájen výzkum zabezpečení
přenosu citlivých dat na síťové úrovni. V další etapě bude následovat implementace
a testovací provoz zvolené metody zabezpečení přenosu a integrace ověřených metod
v rámci systému digitálních knihoven.
Souběžně s oběma předchozími oblastmi budou probíhat práce na zkoumání
kvalitativních aspektů distribuované digitální knihovny s velkými objemy dat
v prostředí rozlehlé komunikační sítě.
| 1.2. |
Cíle řešení výzkumného záměru v roce 2004 a předpokládané výsledky |
- Nově otevřít teoretický výzkum na poli vyhledávání informací v rozsáhlých
kolekcích XML (Extensible Markup Language) dokumentů (zaměření je v souladu
se současnými trendy používanými pro formátování informací jak za účelem
výměny dokumentů, tak i pro ukládání dat v digitálních knihovnách).
- Realizovat návrh architektury a dílčí implementaci referenčního systému pro
zpřístupňování informací uložených v nezávislých heterogenních zdrojích
prostřednictvím centrálně spravovaného souborného "katalogu" - aplikace
v systému MeDiMed pro zpřístupnění medicínských obrazových informací uložených
v nezávislých PACS systémech různých zdravotnických zařízení.
- Zahájit práce na návrhu komplexního výukového systému nad digitální knihovnou MeDiMed.
- Pokračovat v obecném výzkumu dílčích prvků infrastruktury digitálních knihoven
(metadata, interoperabilita, zpřístupňování dat a přenos citlivých údajů
po veřejné počítačové síti).
2. Dosažené cíle a uplatněné výsledky
Již po prvním roce řešení výzkumného záměru došlo k upřesnění a rozšíření oblastí
výzkumu oproti plánu uvedeném v bodě 1.1. Původní oblast A) a její dílčí cíle byly
rozděleny do dvou podoblastí, lépe charakterizujících jednotlivá zkoumaná témata a přístupy:
| |
A1) |
transformace klasických knihoven, koncepce a infrastruktura digitálních knihoven
(vycházející do značné míry ze zkušeností klasických knihovních technologií
a zaměřená jak na teoretické studium vybraných problémů z oblasti digitálních
knihoven tak i na vytváření obecných podmínek pro využití DL-technologií v praxi), |
| A2) |
zpracování a zpřístupnění informací v heterogenních distribuovaných zdrojích
(východiskem byla oblast tradičních informačních systémů - zejména ve webovém
prostředí - s tím, že výzkum se zaměřil na otázky jejich integrace a prezentace). |
Zaměření oblasti C) dle bodu 1.1 výše bylo zase upřesněno tak, aby obecný výzkum
kvality síťových služeb byl soustředěn na technologie pro sběr, zpracování, archivaci
a přenos digitalizovaných medicínských obrazových informací s cílem jejich aplikace
při realizaci konkrétní praktické rozsáhlé digitální knihovny - systému MeDiMed.
V souhrnu lze konstatovat, že všechny hlavní cíle stanovené v návrhu výzkumného
záměru byly naplněny. Podrobný popis naplnění jednotlivých cílů a podcílů VZ je uveden
v dílčích ročních zprávách výzkumného záměru za období 1999-2003, které jsou dostupné
na webu na URL
http://wwwdata.muni.cz/research/cez_item.asp?ID=23.
Cíle pro rok 2004 (šestý dodatečný rok řešení původně pětiletého VZ) - viz bod
1.2 výše - byly splněny. Podrobně jsou postup řešení a dosažené výsledky rozebrány
v dílčí zprávě VZ za rok 2004.
(Pro lepší přehled a sledování souvislostí je dílčí zpráva za rok 2004 prezentována
ve stejné struktuře jako všechny předchozí dílčí zprávy).
| 2.2. |
Stručná souhrnná charakteristika dosažených cílů řešení, přínos řešení výzkumného záměru |
Oblast A1:
Transformace klasických knihoven, koncepce a infrastruktura digitálních knihoven
K dosažení stanovených cílů byl realizován výzkum a vývoj ve třech hlavních směrech:
(1) teoretický výzkum podobnostního hledání a technik pro podobnostní spojování,
(2) výzkum a vývoj specializovaných DL-systémů, (3) návrh a vytvoření infrastruktury
pro podporu tvorby sklízených digitálních knihoven a archivaci webových zdrojů.
ad 1) Hlavním cílem výzkumu podobnostního hledání byl návrh a implementace podpůrných
prostředků za účelem efektivního vyhledávání v rozsáhlých kolekcích digitálních dat.
Výzkum vycházel z našich původních prací o M-stromech pro podobnostní vyhledávání
v metrických prostorech a soustředil se zejména na implementaci a testování podobnostního
D-indexu založeného na transformačních technikách, na výzkum v oblasti přibližného
podobnostního hledání, a na studie technik pro podobnostní spojování (similarity join).
Výsledky tohoto výzkumu, oceněné i na mezinárodní úrovní, přispěly k rozvoji poznání
především (a) návrhem původních metod podobnostního hledání, které se stává určujícím
způsobem prohledávání dat, zejména multimediálních; (b) vývojem technik prohledávání
dat strukturovaných ve formátu XML; (c) využitím síťových architektur k návrhu
škálovatelných indexových struktur. Celá řada původních prací z této oblasti byla
publikována na špičkové mezinárodní úrovni.
ad 2) Pro ověření poznatků získaných ze všech oblastí VZ a moderních DL-technologií
bylo navrženo a realizováno několika systémů digitálních knihoven - jak samostatně
tak i v rámci širší evropské spolupráce zastřešené sítí excelence DELOS: vlastními
silami realizované systémy MeDiMed (podrobněji viz oblast C) a DKF-MU - digitální
knihovna fotografií, sklízená digitální knihovna WebArchiv vyvíjená ve spolupráci
s Národní knihovnou ČR pro archivaci českého webu, česká verze systému ETRDL vyvíjeného
ve spolupráci s výzkumným sdružení ERCIM jako distribuovaná digitální knihovna pro
oblast výzkumných a technických zpráv a konečně systém Scholnet (5RP-EU projekt)
přinášející vedle nového protokolu distribuovaných digitálních knihoven OpenDlib
i novou funkcionalitu při práci s multimediálními dokumenty, vícejazyčným vyhledáváním,
hypermediálním anotačním systémem a personalizovaným šířením informací.
Přínos těchto systémů spočíval nejen v experimentálním ověření širokého spektra
technologií a přístupů pro pořádání a zpřístupnění různorodých digitálních zdrojů
(zejména v systémech Scholnet a ETRDL), ale i v průkopnickém uvedení nových DL-systémů
do praktického využití v řadě oblastí vůbec poprvé na národní úrovni (především systémy
MeDiMed a WebArchiv).
ad 3) Systém WebArchiv, vyvíjený ve spolupráci s Národní knihovnou ČR, je zaměřen
na využití nejmodernějších technologií digitálních knihoven pro uchování a zpřístupnění
národního kulturního dědictví v digitálním prostředí. Řešitelský tým VZ se zaměřil
na návrh a vytvoření národní systémové infrastruktury v oblasti sklízení webu.
Komponenty této infrastruktury tvoří jednak lokalizované nástroje vytvořené
v rámci širší mezinárodní spolupráce (především česká verze metadatového standardu
Dublin Core spolu s nástroji pro tvorbu metadatových záznamů, systémy pro automatizované
sklízení webových dokumentů, jejich identifikaci, správu a archivaci), jednak vlastní
vyvinuté nástroje (pro vyhledávání a zpřístupňování dokumentů v archivu webových zdrojů
či řízení procesu plošných i cílených webových sklizní).
Základním přínosem je: (a) vlastní vytvořená infrastruktura, díky níž bylo možné od
roku 2002 vytvořit a uchovat pro budoucí generace několik poměrně rozsáhlých "snímků"
českého webu, (b) praktické ověření předpokladů, pracovních postupů a dalších podmínek
nezbytných pro další pokračování činnosti, která je nesmírně důležitá z hlediska
zajištění dlouhodobého uchování našeho kulturního dědictví, (c) zapojení České republiky
do vysoce aktuálních mezinárodních aktivit (jsme tak jednou z nemnoha zemí aktivně
řešících problém uchovávání vlastního digitálního informačního dědictví).
Oblast A2:
Zpracování a zpřístupnění informací v heterogenních distribuovaných zdrojích
Výzkumná práce byla orientována na systémovou integraci: (1) formální specifikace -
metadata a meta-transformace, (2) integraci dat a aplikací, (3) autentizační integraci,
(4) integraci prezentace.
ad 1) Výsledkem výzkumné práce v oblasti metadat a meta-transformací je jednak návrh
a implementace jazyka HMDL pro popis datových a dokumentových schémat a vzájemných
vztahů mezi nimi, dále formální definice obecné meta-transformace pro popis transformačních
vztahů mezi dvojicemi sémanticky podobných, avšak schématicky rozdílných datových/dokumentových
struktur a konečně návrh a implementace grafového jazyka Gralan pro práci s podmíněnými
orientovanými pseudografy tvořenými uzly a hranami obecných tříd (oba jazyky přitom
vznikly za kombinované podpory jednak tohoto výzkumného záměru a dále dvou projektů
z programu INCO-Copernicus).
ad 2) V oblasti interoperability informačních zdrojů byly zkoumány, navrhovány a až
na výjimky také implementovány architektury integrovaných systémů pro vzájemnou
výměnu dat mezi heterogenními, autonomními informačními zdroji. Integrované systémy
využívají standardní (kanonické) datové schéma, specifické pro příslušnou aplikační
oblast, a vhodné technologie přenosu a konverze dat, uplatňující poznatky získané
při řešení oblasti A2.1.
Dílčí principy, postupy a technologie byly analyzovány, klasifikovány a publikovány
(lokální vs. kanonická schémata; předávání vs. přebírání dat; centrální resp. sdílené
zrcadlení dat; symetrické / asymetrické / sebezotavující komunikační protokoly;
formáty dat; fázovací, plánovací a aktualizační mechanismy přenosů dat atd.) a prakticky
uplatněny v systémech MeDiMed (aplikační oblast medicínských obrazových dat), ISVaV
(oblast informací o vědě a výzkumu), SIMS (oblast matričních dat o studentech a studiích),
W3 MU (oblast veřejných prezentačních dat univerzity), Inet MU (oblast PaM, ekonomiky a
dalších), Clearing MU (oblast účetnictví) aj.
ad 3) V oblasti diferencovaného a chráněného zpřístupňování informací byly studovány
a navrhovány technologie minimalizace správy prezentačních systémů, uživatelem řízeného
aplikačního zabezpečení přístupu k citlivým datům, proxy pro přístup k licencovaným
informacím a poskytování autentizace a autorizace v informačních systémech na základě
jednotné databáze identit.
ad 4) V rámci tématu strukturovaných uživatelských rozhraní pro prezentování informací
a v souvislosti s prací na metadatových a meta-transformačních formátech (viz A2.1)
byly analyzovány přístupy využívající interní grafovou reprezentaci objektů a vztahů
a byla navržena prezentační forma hyperdokumentu, postavená na dokumentovém schématu
a mající úzkou vazbu na definice transformačních vztahů mezi datovými a dokumentovými
schématy. Dále byly zkoumány, klasifikovány a publikovány architektury a metodické
principy tvorby strukturovaných uživatelských rozhraní k informačním zdrojům.
Výsledky dosažené v oblasti A2 přispěly k rozvoji znalostí v oblasti datové integrace.
Byly prezentovány na řadě mezinárodních konferencí specializovaných na oblast moderních
databázových a informačních systémů. Byly také využity v návrzích architektur systémů
pro vzájemnou výměnu a jednotnou prezentaci dat v rámci výzkumného záměru i mimo něj,
a implementovány v informačních systémech MU.
Oblast B:
Bezpečnostní protokoly a mechanismy zpřístupnění a přenosu citlivých informací
v prostředí veřejné počítačové sítě
Hlavním cílem byl návrh bezpečného síťového prostředí a efektivní systémové
infrastruktury pro provoz digitálních knihoven v prostředích privátní i veřejné
počítačové sítě.
(1) Byly postupně zkoumány a rozvíjeny metody bezpečného přístupu k síti
prostřednictvím globálního nezabezpečeného média, které měly umožnit zejména ochranu
dat systémů digitálních knihoven (a zobecněně i jakýchkoliv dat na MU) a respektování
příslušného právního rámce jejích využívání (praktickým příkladem jsou např. licenčních
ujednání k placeným elektronickým informačním zdrojům nebo podmínky pro zpřístupnění
dat z lékařských diagnostických zařízení). Ve finální verzi byla v rámci využití
adresářových služeb na bázi LDAP navržena a implementována technologie zabezpečeného
vzdáleného přístupu k informačním zdrojům a prostředkům počítačové sítě. Tato technologie,
umožňující přistupovat k zabezpečeným informačním zdrojům univerzitní počítačové sítě,
je v současné době na Masarykově univerzitě již nasazena v rutinním provozu a využívána
několika stovkami uživatelů. Řešení pokrývá jak potřebu bezpečného vzdáleného přístupu
k síti MU přes otevřený Internet, tak i plné zabezpečení (včetně šifrování veškerých dat)
vznikající bezdrátové přístupové sítě MU. Do budoucna se počítá s integrací tohoto řešení
do projektu eduRoam.cz realizovaného sdružením CESNET z.s.p.o. (tento projekt má umožnit
uživatelům transparentně využívat služeb sítí v rámci skupiny zapojených vysokých škol).
(2) Byla vytvořena také metodika pro přenos mimořádně citlivých medicínských dat
v metropolitní síti a také prostřednictvím nezabezpečené sítě obecného Internetu.
Řešení je v rutinním provozu a v rámci systému MeDiMed zabezpečuje v případě
některých nemocnic plně digitalizovaný provoz diagnostické techniky.
Tato oblast výzkumného záměru byla plánována jako podpůrná aktivita, jejímž cílem
nebyl ani tak vývoj nových technologií, jako spíše zkoumání dostupných síťových
komponent, výběr optimálních variant a navržení uceleného komunikačního systému
dle požadavků řešitelů VZ. Její hlavní přínos je (a) ve vytvoření spolehlivého
zabezpečeného síťového prostředí, které bylo jednou z kritických podmínek pro
praktickou realizaci digitálních knihoven přenášejících, uchovávajících a zpřístupňujících
neveřejná či citlivá data, (b) v aplikaci technologií ověřených při řešení výzkumného
záměru do síťové infrastruktury mateřské instituce.
Oblast C:
Některé aspekty zajištění kvality síťových služeb pro potřeby digitálních knihoven
Oproti původním záměrům zkoumat problematiku kvality služeb počítačové sítě spíše
v obecné rovině byl v průběhu prvního roku řešení hlavní cíl této oblasti konkretizován
na problematiku využití síťových služeb pro sběr, zpracování, archivaci a přenos
velko-objemových digitalizovaných medicínských obrazových informací v rámci vývoje
systému MeDiMed - Metropolitního archívu medicínských obrazových informací (Metropolitan
Digital Imaging System in Medicine). Zkoumáno bylo široké spektrum problémů - patřily
mezi ně otázky standardizace formátu medicínských digitálních obrazových informací,
problematika pořizování digitálních výstupů z diagnostických modalit různých typů,
vzdálený přenos dat, archivace a zpřístupnění velkých objemů dat v reálném čase podle
potřeb a požadavků rozdílných lékařských aplikací, realizace a provoz rozsáhlého
metropolitního úložiště medicínských snímků, zabezpečení přenosu vysoce citlivých
lékařských dat po nezabezpečené veřejné datové síti, výzkum v oblasti parametrů
zobrazovacích stanic pro různé typy lékařských aplikací, a další. Souběžně byly
analyzovány otázky legislativní (jak zasadit navrhovaná řešení do stávajícího
legislativního rámce a jak tento rámec upravit pro nové aplikace a širší nasazení
systému), ekonomické (ověřování technologií v praxi a zejména náklady na pilotní
realizace systému vysoce překračovaly možnosti financování z jednoho zdroje) a
koordinační (realizační část vyžadovala úzkou spolupráci výzkumných týmů, vedení
nemocnic, reprezentantů specializovaných lékařských odborností, zástupců regionu,
reprezentantů státní správy i příslušných ministerstev).
Svým integračním charakterem, rozsahem, objemem financí, interdisciplinaritou,
náročností koordinace systému s velkým počtem partnerů a striktními provozními
požadavky (bezpečnostními, legislativními, technickými) se aktivity MeDiMed staly
nejrozsáhlejším aplikačním výstupem výzkumného záměru. V závěru roku 2004 představoval
MeDiMed komplexní systém zahrnující samotný digitální archív obsahující 1.8 miliónů
snímků o objemu 2,5TB dat, hlavní a záložní pracoviště vybavená potřebnou výpočetní,
úložnou a komunikační technologií, zárodek výukového centra a další potřebnou
infrastrukturu.
Systém MeDiMed využívá v praxi 6 brněnských nemocnic připojených prostřednictvím
privátní optické sítě a dvě vzdálená mimobrněnská nemocniční zařízení připojená
prostřednictvím zabezpečené veřejné počítačové sítě. V těchto nemocničních zařízeních
jsou na systém MeDiMed připojeny desítky modalit (diagnostických přístrojů) a více
než stovka prohlížecích stanic.
Přínos řešení v této oblasti spočíval v (1) propojení výsledků výzkumu celého
VZ pro návrh a vytvoření kompletní infrastruktury systému pro práci s digitální
obrazovou informací v medicíně, (2) prvním síťovém řešení nemocničních systémů
PACS (Picture Archiving Communicating System) v České republice, které umožnilo
zahájit spolupráci nemocničních zařízení, (3) standardizaci technologií v dané
oblasti v ČR (standard DICOM, PACS a další), (4) interdisciplinární spolupráci
lékařů s informatiky a síťovými specialisty, (5) vytvoření rozsáhlého archivů snímků
jako východiska pro další výzkum v oblasti zpracování a vyhodnocování medicínské
obrazové informace, (6) podpoře lékařské operativy v zapojených nemocničních
zařízeních, (7) vytvoření podmínek pro přípravu odpovídajícího legislativního
rámce pro sdílení síťové digitální obrazové informace v medicíně.
Souhrnné údaje za všechny oblasti výzkumného záměru:
Za 6 let řešení výzkumného záměru byly jeho výsledky publikovány celkem ve 164
publikacích a prezentovány na 84 vědeckých a odborných konferencích, z toho 51
konferencích v zahraničí. Výsledky práce byly oceněny mezinárodní vědeckou komunitou
pozváním k členství v programových výborech mezinárodních konferencí, jako jsou
ACM SIGMOD, VLDB, EDBT, ECDL, SOFSEM a dalších, a účastí řešitelského pracoviště
v evropské síti excellence digitálních knihoven DELOS (v 5. i 6. RP EU).
Vedle prací na vlastním výzkumném záměru byli členové řešitelského týmu řešiteli
nebo se významně podíleli na řešení 5 evropských a 11 národních projektech výzkumu
a vývoje z oblasti digitálních knihoven (viz níže) a spolupracovali s řadou
zahraničních výzkumných pracovišť v dané oblasti (ISTI-CNR Pisa, University of
Bologna, University of Modena, Italy; ICS-FORTH Greece; Fraunhofer Institute IPSI,
Germany; INRIA France; CCLRC Rutherford Appleton Laboratory, UK; LIACC University of
Porto, Portugal; University of Freiburg, Germany; Oklahoma State University,
Stillwater, Oklahoma, USA.).
Projekty:
a) mezinárodní projekty
- INCO Copernicus "HyperMedata" - Hypermedia Presentation of Integrated
Medical Data (No.940946, 1995-1999, RAL, UK),
- INCO Copernicus "StraDiWare" - Formal Specification Tools for Strategic
Planning (No.977132, 1999-2003, RAL, UK),
- projekt 5. rámcového programu EU "SCHOLNET" - A Digital Library Testbed
to Support Networked Scholarly Communities (EU-IST-1999-20664, 2001-2003, CNR-IEI),
- projekt 5. rámcového programu EU "DELOS" - Network of Excellence on Digital
Libraries" (EU-IST-1999-12262, 1999-2003),
- projekt 6. rámcového programu EU "DELOS" - Network of Excelence on Digital
Libraries (No. G38-507618, 2004-2007).
b) národní projekty
- "Integrace CD-ROM serveru MU do www-virtuální knihovny MU" (MŠMT INFRA II, LB98015, 1998-1999),
- "Current Contents Connect na vysokých školách v ČR" (MŠMT INFRA II, LB98100, 1998-1999),
- "Rozvoj Brněnské počítačové sítě pro potřeby výzkum a vývoje" (MŠMT INFRA II LB98229, 1998-2000),
- "Registrace, ochrana, a zpřístupňování domácích elektronických zdrojů v síti Internet"
(MK KZ00P02OLK005, 2000-2002),
- "Centrum informačních zdrojů pro oblast informatiky na bázi moderních počítačových
technologií" (MŠMT LI00027, 2000-2003),
- "Koncepce informační infrastruktury výzkumu a vývoje" (MŠMT LS013244, 2001),
- "Telemedicína v Brně" (IGA MZ 2001-2002),
- "Vysokorychlostní přenosy a archivace digitálních obrazových medicínských dat"
(IGA MZČR, NO6760-3/2001, 2001-2003),
- "Přenos medicínských obrazových dat" (grantový program CESNET2 Vysokorychlostní
síť národního výzkumu a její aplikace, 2002-2004),
- "Zvýšení rychlosti přístupu a dostupnosti metropolitního archivu medicínských
obrazových informací" (CESNET2, 2003-2004),
- "Autentizovaný přístup k službám metropolitního archívu medicínské obrazové
informace" (FR CESNET2, 2004-2005).
Dopad řešení výzkumného záměru na vykonavatele byl jednak v propojení a koncentraci
různých směrů výzkumných aktivit ÚVT pod společné zastřešení digitálních knihoven,
ve stabilizaci výzkumné základny ÚVT, a ve vytvoření rozsáhlé infrastruktura pro
pokračující výzkum digitálních knihoven, zejména v oblasti obrazových dat v medicíně
a při archivaci webových zdrojů.
3. Nejvýznamnější výsledky řešení výzkumného záměru
Mezi nejvýznamnější výsledky za celé období řešení výzkumného záměru (1999-2004)
jsme zařadili celkem 51 publikací a 20 aplikovaných výstupů. Vzhledem k povaze
výzkumného záměru, který byl orientován na aplikovaný (nikoliv základní) výzkum
v interdisciplinární oblasti s poměrně rozsáhlou aplikační spoluprací v národním
i mezinárodním měřítku, přičemž finanční nároky některých aplikací výrazně převyšovaly
možnosti financování z jednoho zdroje (systém MeDiMed), byla významná část
prezentovaných výsledků dosažena řešením VZ a obsahově navazujících projektů nebo grantů.
Z 51 uváděných publikací bylo 18 výsledkem řešení výhradně VZ a 33 v součinnosti
s navazujícími projekty, u 20 uváděných aplikovaných výstupů je tento poměr 12:8.
Výsledky dosažené výhradně řešením výzkumného záměru jsou označeny symbolem [VZ].
| a) |
Odborné knihy nebo články v odborných knihách |
Zezula, Pavel - Amato, Giuseppe - Rabitti, Fausto. Processing XML Queries with
Tree Signatures. In Intelligent Search on XML Data. Berlin : Springer, 2003. s. 247-262,
16 s. LNCS 2818. ISBN 3-540-40768-5.
| b) |
Články v impaktovaných vědeckých časopisech |
Amato, Giuseppe - Rabitti, Fausto - Savino, Pasquale - Zezula, Pavel. Region
proximity in metric spaces and its use for approximate similarity search. ACM
Transactions on Information Systems, New York : ACM Press, 21, 2, od s. 192-227,
36 s. ISSN 1046-8188. 2003.
Dohnal, Vlastislav - Gennaro, Claudio - Savino, Pasquale - Zezula, Pavel. D-Index:
Distance Searching Index for Metric Data Sets. Multimedia Tools and Applications,
Kluwer Academic Publishers, 21, 1, od s. 9-33, 24 s. ISSN 1380-7501. 2003.
| c) |
Články v recenzovaných vědeckých časopisech v cizím jazyce nebo
ve sbornících v cizím jazyce |
Oblast A1:
Zezula, Pavel. A Hashed Schema for Similarity Search in Metric Spaces. In Proceedings
of the First DELOS Network of Excellence Workshop on "Information Seeking, Searching
and Querying in Digital Libraries". 1. vyd. Zurich : ERCIM, 2000, s. 83-87. Workshop
series. ERCIM-01-W01. [VZ]
Bartoň, Stanislav. Indexing Structure for Discovering Relationships in RFD Graph
Recursively Applying Tree Transformation. In Semantic Web Workshop at 27th Annual
International ACM SIGIR Conference. Sheffield : University of Sheffield 2004. s. 58-68. [VZ]
Zezula, Pavel - Amato, Giuseppe - Debole, Franca - Rabitti, Fausto - Savino, Pasquale.
A Signature-Based Approach for Efficient Relationship Search on XML Data Collections.
In Second International XML Database Symposium, XSym 2004. 1. vyd. Berlin : Springer,
2004. od s. 82-96, 15 s. ISBN 3-540-22969-8.
Zezula, Pavel - Mandreoli, Federica - Martoglia, Riccardo. Tree Signatures and Unordered
XML Pattern Matching. In SOFSEM 2004: Theory and Practice of Computer Science, 30th
Conference on Current Trends in Theory and Practice of Computer Science. LNCS 2932.
Berlin : Springer, 2004. od s. 122-139, 18 s. ISBN ISBN 3-540-2077.
Mandreoli, Federica - Martoglia, Richardo - Zezula, Pavel. Unordered XML Pattern
Matching with Tree Signatures. In Twelfth Italian Symposium on Advanced Database
Systems. Italy : LITHOSgrafiche, 2004. od s. 78-85, 8 s. ISBN 88-901409-1-7.
Batko, Michal - Gennaro, Claudio - Zezula, Pavel. A P2P System for Searching in
Metric Spaces. In Proceedings of the Twelfth Italian Symposium on Advanced Database
Systems. Cagliari : LITHOSgrafiche - Cagliari, 2004. od s. 410-417, 8 s. ISBN 88-901409-1-7.
Batko, Michal - Gennaro, Claudio - Zezula, Pavel. A Scalable Nearest Neighbor Search
in P2P Systems. In 2nd International VLDB Workshop on Databases, Information Systems
and Peer-to-Peer Computing. Toronto : VLDB Publishing, 2004. od s. 64-77, 14 s.
Batko, Michal - Gennaro, Claudio - Zezula, Pavel. Scalable and Distributed Similarity
Search in Metric Spaces. In Distribute Data & Structures. 1. vyd. Canada : Carleton
Scientific, 2004. od s. 107-116, 10 s. ISBN 1-894145-18-6.
Batko, Michal - Gennaro, Claudio - Pasquale, Savino - Zezula, Pavel. Scalable
Similarity Search in Metric Spaces. In Pre-proceedings of the Sixth Thematic Workshop
of the EU Network of Excellence DELOS. Cagliari : Edizioni Progetto Padova, 2004.
od s. 213-224, 12 s.
Batko, Michal. Similarity Search in P2P Networks. In Proceedings of the PhD Wokshops
of the EDBT and ICDE Conferences. Heraklion : Crete University Press, 2004. od s.
51-60, 10 s. ISBN 960-524-177-3. [VZ]
Dohnal, Vlastislav. An Access Structure for Similarity Search in Metric Spaces.
In Proceedings of ICDE/EDBT 2004 Joint Ph.D. Workshop, Heraklion : Crete University
Press, 2004. od s. 149-158, 10 s. ISBN 960-524-177-3. [VZ]
Žabička, Petr. Archiving the Czech Web: Issues and Challenges. In Proceedings of the
3rd Workshop on Web Archives (in conjunction with the 7th European Conference on
Research and Advanced Technologies for Digital Libraries, ECDL 2003). Trondheim :
Neuveden, 2003. od s. 111-117, 7 s. [VZ]
Zezula, Pavel - Dohnal, Vlastislav - Genarro, Claudio - Savino, Pasquale. Similarity
Join in Metric Spaces. In Proceedings of the European Conference on Information
Retrieval Research. Berlin : Springer-Verlag, 2003. od s. 452-467, 16 s. ISBN 3-540-01274-5.
Zezula, Pavel - Amato, Giuseppe - Debole, Franca - Rabitti, Fausto. Tree Signatures
for XML Querying and Navigation. In Database and XML Technologies. Berlin : Springer,
2003. od s. 149-163, 15 s. ISBN 3-540-20055-X.
Dohnal, Vlastislav - Gennaro, Claudio - Zezula, Pavel. Similarity Join in Metric
Spaces Using eD-index. In Database and Expert Systems Applications, DEXA 2003. LNCS
2736. Berlin : Springer, 2003. od s. 484-493, 10 s. ISBN 0302-9743.
Amato, Giuseppe - Debole, Franca - Zezula, Pavel - Rabitti, Fausto. YAPI: Yet another
path index for XML searching. In Proceedings of the 7th European Conference on Research
and Advanced Technology for Digital Libraries, ECDL'2003. Berlin : Springer, 2003. od
s. 176-187, 12 s. ISBN 3-540-40726-X.
Amato, Giuseppe - Debole, Franca - Zezula, Pavel - Rabitti, Fausto. A Path Index
for Efficient XML Path Expression Processing. In Proceedings of the Eleventh Italian
Symposium on Advanced Database Systems. Italie : Rubbettino Editore, 2003. od s. 21-28, 9 s.
Batko, Michal - Gennaro, Claudio - Zezula, Pavel. Scalable and Distributed Similarity
Search in Metric Spaces. In 5th International Workshop on Distributed Data and Structures.
Thessaloniki : Aristotle University of Thessaloniki, 2003. od s. 81-90, 10 s.
Dohnal, Vlastislav - Gennaro, Claudio - Savino, Pasquale - Zezula, Pavel. Access
Structures for Advanced Similarity Search in Metric Spaces. In Proceedings of the
Eleventh Italian Symposium on Advanced Database Systems. Italie : Rubbettino Editore,
2003. od s. 483-494, 12 s.
Zezula, Pavel - Dohnal, Vlastislav - Claudio, Genarro. A Metric Index for Approximate
Text Management. In Information Systems and Databases. Anaheim - Calgary - Zurich:
ACTA Press, 2002, s. 37-42. Proceedings of the IASTED International Conference (Tokyo,
September 2002). ISBN 0-88986-362-8.
Zezula, Pavel - Dohnal, Vlastislav - Gennaro, Claudio - Savino, Pasquale. Separable
Splits of Metric Data Sets. In SEBD01 - Italian Symposium on Database Systems. Milano :
University Press, 2001, s. 45-62.
Zezula, Pavel - Savino, Pasquale - Gennaro, Claudio. Similarity Search in Metric
Databases through Hashing. In ACM Multimedia 2001 Workshops. USA : ACM Press, 2001,
s. 1-5. ISBN 1-58113-395-2.
Amato, Giuseppe - Zezula, Pavel - Rabitti, Fausto - Savino, Pasquale. Estimating
Proximity of Metric Ball Regions for Multimedia Data Indexing. In Advances in Information
Systems. 1. vyd. Berlin : Springer, 2000, s. 71-80. LNCS No.1909. ISBN 3-540-4118.
Amato, Giuseppe - Savino, Pasquale - Fausto, Rabitti - Zezula, Pavel. Approximate
Similarity Search in Metric Data by Using Region Proximity. In Proceedings of the First
DELOS Network of Excellence Workshop on "Information Seeking, Searching and Querying
in Digital Libraries". Zurich : ERCIM, 2000, s. 101-106. Workshop series. ERCIM-01-W01.
Řepišová, Zuzana. The Implemantation of an Automated System at the University Library
in Bratislava, Slovakia. In Library Automation in Transitional Societies. 1. ed. New
York : Oxford University Press, 2000, s. 204-218. ISBN 0-19-513262-9. [VZ]
Bartošek, Miroslav. ATpar : Heterogeneous Virtual WWW Catalogue. In CASLIN '99 :
Uninon calalogues: Their organization and Services, 30th May - 3rd June 1999, Zadov,
Czech Republic : Proceedings. Praha : National Library CR, 1999. ISBN 80-7050-354-8,
s. 142-148. [VZ]
Oblast A2:
Kohoutková, Jana. Meta-Transformations in Systems Integration: The Concept and the
Use. In Proc. of EUNIS'2004. Ljubljana : Univerza v Ljubljani, 2004. od s. 253-258,
6 s. ISBN 961-6209-46-9. [VZ]
Měcháček, Jaroslav - Kohoutková, Jana - Burianová, Lucie - Jurtíková, Alena - Jedlička,
Ivan - Burian, Ivan. Masaryk University Clearing System. In Proc. of EUNIS'2004.
Ljubljana : Univerza v Ljubljani, 2004. od s. 316-320, 5 s. ISBN 961-6209-46-9. [VZ]
Kohoutková, Jana. Hypermedia Interfaces to Relational Data Structures (A Way to
Presentation Integration). In Proc. of EUNIS'2003. Amsterdam : Universiteit van
Amsterdam, 2003. od s. 193-198, 6 s. ISBN 90-9017079-0. [VZ]
Kohoutková, Jana. Hypertext Presentation of Relational Data Structures. In Proc. of
ITAT'2002. Košice : UPJŠ v Košiciach, 2002. od s. 33-44, 12 s. ISBN 80-7097-499-0. [VZ]
Kohoutková, Jana. University Information Infrastructure - An Integration Challenge.
In Proc. of EUNIS'2002. Porto : Faculdade de Engenharia da Universidade do Porto, 2002,
s. 268-271. ISBN 972-752-051-0. [VZ]
Kohoutková, Jana. Meta-Level Transformations in Systems Integration. In Proc. of ADBIS
2002. Bratislava : Slovak University of Technology in Bratislava, 2002, s. 121-130.
ISBN 80-227-1744-4. [VZ]
Kohoutková, Jana. Union Students' Register: Data Integration to Support National
Education Management. In Proc. of EUNIS 2000. Poznan : Instytut Informatyki Politechniki
Poznanskiej, 2000, s. 59-66. ISBN 83-913639-1-0. [VZ]
Skoupý, Karel - Kohoutková, Jana - Benešovský, Miroslav - Jeffery, K.G. HYPERMEDATA
Approach : a way to systems integration. In Proc. of ADBIS'99. Maribor : University of
Maribor, 1999. ISBN 86-435-0285-5, s. 9-15.
Oblast C:
Dostál, Otto - Filka, Miloslav - Petrenko, Martin. New Possibilities of Multimedia
Applications in Medicine. ELMAR, Zadar : Croatian Society Electronics in Marine, 2004,
June, od s. 402-405, 4 s. ISSN 1334-2630. 2004.
Dostál, Otto - Javorník, Michal - Slavíček, Karel - Petrenko, Martin. Development of
Reginal Centre for Medical Multimedia Data Processing. In Communications, Internet,
and Information Technology. St. Thomas (USA) : ACTA Press, 2004. s. 632-636. ISBN
0-88986-445-4. [VZ]
Schmidt, Michal - Dostál, Otto - Javorník, Michal. MEDIMED - Regional PACS Centre
in Brno. In EuroPACS - MIR 2004. Trieste-Italy : University of Trieste, 2004. od s.
463 -465, 3 s. ISBN 88-8303-150-4.
Dostál, Otto - Filka, Miloslav - Petrenko, Martin. University computer network and
its application for multimedia transmission in medicine. WSEAS TRANSACTIONS on SYSTEMS,
Rio de Janeiro, 2/2003, January, od s. 148-150, 3 s. ISSN 1109-2777. 2003.
Petrenko, Martin - Ventruba, Pavel - Dostál, Otto. First Application of Picture
Archiving and Communication System (PACS) in Gynecologic Endoscopy. In ISGE - 6th
Regional Meeting. Bangkok : ISGE, 2002, s. 53-56. [VZ]
Dostál, Otto - Filka, Miloslav - Petrenko, Martin. Multimedia Communication Transmission
in Medicine. In PROCEEDINGS VIPromCom-2002. Zadar (Croatia) : Croatian Society Electronics
in Marine - ELMAR,Zadar, Croatia, 2002, s. 53-55.
Dostál, Otto - Filka, Miloslav - Petrenko, Martin. University computer network and its
application for multimedia transmission in medicine. In WSEAS Int. Conf. on Information
Security, Hardware/Software Codesign, E-Commerce and Computer Networks. Rio de Janeiro,
Brazil : WSEAS org., 2002, s. 1961-1964. ISBN 960-8052-74-9.
Dostál, Otto - Javorník, Michal. Some Security Aspects of Picture Archiving and
Communication System in The Environment of More Hospitals. In Transformation of CEEC
Economies tu EU Standards. Brno - Trento (Italy) : MSD, spol s r.o., 2002, s. 49-52.
ISBN 80-86510-27-1. [VZ]
Dostál, Otto - Filka, Miloslav - Slavíček, Karel. Network infrastructure for transport
of medicine video data. In Telecommunication and Signal Processing TSP 2002. Brno :
Brno University of Technology, 25 International Conference, 2002, s. 13-16. ISBN 80-214-2172-X.
Petrenko, Martin - Dostál, Otto - Ventruba, Pavel - Filka, Miloslav. First Experiences
with Picture Archiving and Communication System in Brno Hospitals. In IEEE Region 8,
EUROCON'2001, International Conference on Trends in Communications. Bratislava : Zdruzenie
J.M., 2001, s. 17-19. Volume 1/2. ISBN 0-7803-6490-2.
Petrenko, Martin - Dostál, Otto - Ventruba, Pavel. First Experiences with Picture
Archiving and Communication Systems (PACS). In Gynecology. Israel Journal of Obstetrics
and Gynecology, Tel Aviv (Israel) : Menachem HorowitzPublishing, Tel Aviv, 2000, 3, s.
128-130. ISSN 0792-4569. [VZ]
Dostál, Otto - Filka, Miloslav - Slavíček, Karel. Videoconference using ATM in medicine.
In Proc of 22nd International Conference Telecommunications and Signal Processing TSP 99
Brno. Brno : SEI VUT, 1999. ISBN 80-214-1154-6, s. 195-197.
Dostál, Otto - Filka, Miloslav - Molnár, K - Slavíček, Karel. Experimental PABXs traffic
in ATM networks. DT Bratislava, 1999. ISBN 80-223-0429-1, s. 57-60.
Dostál, Otto - Petrenko, Martin - Filka, Miloslav. Picture Archiving and Communication
Systems. In 23 International Conference on Telecommunications and signal processing TSP 2000.
Brno, 2000, s. 25-27. ISBN 80-7204-161-4.
Oblast A1:
Název: SCHOLNET - DL Testbed to Support Networked Scholarly Communities
2001-2003
Anotace: Prototyp digitální knihovny vyvinutý v rámci IST programu EU (IST-1999-20664).
Ve spolupráci se 7 partnery ze 6 evropských zemí byla vyvinuta prototypová digitální
knihovna, která kromě standardních funkcí pro získávání digitálního obsahu, jeho popis,
archivaci, zpřístupňování, vyhledávání a poskytování zajišťuje také podporu pro
netextové typy dat, hypermediální anotace, vícejazyčné vyhledávání a zpřístupnění
informací a personalizované šíření informací. Další informace:
http://www.ercim.org/scholnet/
Název: WebArchiv
2000-2004
Anotace: Systémová a technická infrastruktura pro automatizované sklízení
a archivaci českého webu (české verze nástroje Nedlib Harvester pro sklízení webových
zdrojů a NWA Toolset pro zpřístupnění webového archivu, lokalizované nástroje pro
tvorbu metadatových záznamů v Dublin Core, generátor URN na bázi čísla národní bibliografie,
MD5 kalkulátor pro ověřování integrity souborů a identifikaci, původní nástroje pro
vyhledávání a zpřístupnění dat v archivu). Na podzim 2001 a v roce 2002 realizovány
první ověřovací sklizně českého webu. V roce 2004 byla realizována první celoplošná
sklizeň, při níž bylo staženo a archivováno 33 miliónů souborů o objemu 1 TB dat.
Řešitelské pracoviště provozuje i jádro technické infrastruktury (webarchiv server
a webarchiv archiv). Další informace:
http://webarchiv.nkp.cz/
Název: Česká verze metadatového standardu Dublin Core [VZ]
2000-2002
Anotace: V roce 2000 byla vytvořena česká verze metadatového standardu
Dublin Core pro popis a identifikaci informačních zdrojů, následně pak byla vytvořena
i česká varianta kvalifikovaného DC a kompletní česká verze byla zařazena do
mezinárodního registru DCMI Metadata Registry (
http://dublincore.org/dcregistry/). Pro práci se standardem Dublin Core bylo
vytvořeno několik nástrojů - především lokalizovaný generátor a extraktor umožňující
tvorbu metadatových záznamů Dublin Core v několika formátech, včetně formátů HTML a XML,
a provázaný nástroj pro přidělování jednoznačného identifikátoru elektronického dokumentu
na bázi NBN - čísla národní bibliografie. Další informace na:
http://www.ics.muni.cz/dublin_core/
Název: Digitální knihovna fotografií (DKF-MU) [VZ]
2000-2004
Anotace: Specializovaná digitální knihovna pro potřeby obrazových digitálních
informací, především pro potřeby realizace digitálních fotosbírek na MU. Vyvinuli a
implementovali jsme vlastní softwarové řešení, v němž je digitální knihovna pojata
jako systém jednotlivých globálně prohledávatelných DL-kolekcí, každá z nich tvořící
hierarchický trojúrovňový systém: kolekce (digitální tématická sbírka), složka (množina
fotografií vztahující se k jednomu objektu - osobě, věci, události), fotografie (množina
terminálních objektů reprezentujících danou fotografii - archivní, přístupové a náhledové
obrazové soubory). S podporou systému DKF-MU byla realizována kompletní digitalizace
fotografické sbírky univerzitního archívu Osobností MU, bylo vytvořeno pět dalších
digitálních obrazových kolekcí a systém byl použit i pro podporu tvorby rozsáhlých
aplikací z oblasti elektronického publikování.
Název: ETRDL -CZ
2000-2001
Anotace: Distribuovaná digitální knihovna šedé literatury z oblasti computer
science a matematiky evropského výzkumného sdružení ERCIM (the ERCIM Technical
Reference Digital Library). Řešitelé vyvíjeli českou verzi této digitální knihovny
postavené na protokolu Dienst (vyvinutém na Cornell University pro systém NCSTRL -
Networked Computer Science Technical Reference Library). V rámci řešení výzkumného
záměru byla provedena úplná lokalizace systému do českého prostředí, zprovozněn národní
uzel sítě ETRDL a vyvinut specifický způsob začleňování technických a výzkumných zpráv
FI MU a jejich zpřístupnění. Poté, co Cornelova univerzita ukončila v roce 2001 podporu
protokolu Dienst, nebyl již systém dále rozvíjen a v současnosti již není v provozním stavu.
Oblast A2:
Název: SIMS (Sdružené informace matrik studentů) [VZ]
1999-2004
Anotace: Systém řešící sdružování dat uložených v nezávislých studijních
informačních systémech vysokých škol ČR do souborné centrální databáze provozované
MŠMT ČR, v níž probíhá centrální zpracování a odkud jsou data prezentována uživatelům
(http://sims.ics.muni.cz). Sdružování se děje
na principu jednotné definice datového rozhraní (standardu pro oblast VŠ studia,
definovaného řešiteli ve spolupráci s MŠMT ČR), lokální konverze všech dat do tohoto
standardu (tj. integrovaný systém pracuje pouze se standardním datovým schématem)
a přenosu jednotným komunikačním rozhraním. Vedle problému sběru dat, integrace dat
a zpětné distribuce zpracovaných (verifikovaných, doplněných) dat v distribuovaném
heterogenním systému byly ve VZ zkoumány i technologie ochrany a autorizace přenášených údajů.
Název: IRIS MU (Integrovaný řídící a informační systém MU) [VZ]
1999-2004
Anotace: Základ univerzitní informační infrastruktury, který představuje
hlavní výstup výzkumu v oblasti on-line integrace dat uložených v nezávislých
distribuovaných zdrojích (zde celouniverzitních databázích). Vedle integrace dat
za účelem jednotné prezentace byl řešen i problém integrace a zpětné distribuce
dat v datových zdrojích - systém je tvořen více nezávislými datovými úložišti,
která se obsahově v nezanedbatelné míře překrývají. Implementovány byly dvě
alternativy řešení: centrální varianta má jediný referenční zdroj, v němž se provádějí
všechny modifikace sdílených dat primárně (na základě systému přístupových práv tohoto
zdroje) a odkud se sdílená data odezírají do dalších úložišť; sdílená varianta umožňuje
existenci dvou (nebo více) zcela rovnoprávných referenčních zdrojů, které si vzájemně
důvěřují a modifikace dat vzájemně odezírají (modifikace dat jsou řízeny místními,
vzájemně dohodnutými přístupovými právy). Pro intranetové subsystémy IRIS MU byla
navržena a implementována úroveň osobního zabezpečení přístupu k citlivým datům, tzv.
uživatelská IP-bezpečnost, realizovaná na aplikační úrovni, dále proxy pro přístup
k licencovaným informacím a rovněž poskytování autentizace a autorizace v informačních
systémech (ať již interně vyvíjených na MU nebo dodávaných externím dodavatelem) na
základě jednotné databáze identit zcela odstíněné od informačních systémů a jejich
vývojářů. Pro intranetový subsystém Inet MU (https://inet.muni.cz)
bylo navrženo a implementováno řešení postavené na technologii
J2EE a definici jednotného rozhraní mezi aplikační a prezentační vrstvou systémové
architektury. Rozhraní využívá formát XML pro popis dat a formát XSLT pro popis
datových transformací.
Název: WWW MU (institucionální internetová prezentace MU) [VZ]
1999-2004
Anotace: Institucionální webová prezentace Masarykovy univerzity
http://www.muni.cz. Využívá technologie strukturovaných
uživatelských rozhraní pro prezentování informací a principy tvorby prezentačních systémů
postavených nad relační databází. Řešitelé se zejména zaměřili na minimalizaci správy
prezentačního systému (zero administration) zahrnující automatizované generování
prezentačních hyperdokumentů (hypertextových stránek) a jejich vzájemných vazeb
(hyperlinků), postavené na systému evidence a klasifikace generujících skriptů a
jejich parametrů. Veřejná webová prezentace Masarykovy univerzity byla v roce 2001
oceněna sdružením EUNIS-CZ jako nejlepší v soutěži univerzit ČR.
Název: HMDL (HyperMeData Language)
1999-2004
Anotace: Formální jazyk pro popis entitně-relačních datových schémat,
hypertextových dokumentových schémat a transformací mezi nimi, určený k podpoře
konverzí datových instancí mezi takovými schématy. Práce navázala na výsledky dříve
řešeného projektu HyperMeData (Hypertextová prezentace integrovaných medicínských dat,
INCO-Copernicus, 1995-99) a v rámci řešení VZ je rozšířila zejména v části formálních
popisů dokumentových schémat. Dále byla navržena prezentační forma pro data popsaná
hypertextovým dokumentovým schématem (tvořeným tzv. sekcemi a referencemi), složená
z indexových, informačních a vazebných stránek provázaných hyperlinky, podávajících
úplný přehled o struktuře dokumentu a informačním obsahu všech jeho sekcí a umožňujících
úplnou navigaci mezi instancemi sekcí podle všech hierarchických (generalizačních/specializačních)
vztahů a definovaných referencí (včetně komplexních referencí s vlastními atributy).
V neposlední řadě byla zformulována obecná definice meta-transformace pro popis
transformačních vztahů (typu HMDL, ale také např. XSLT apod.) mezi dvojicemi sémanticky
ekvivalentních, avšak schématicky heterogenních datových/dokumentových struktur.
Meta-transformací byly poté popsány typické třídy heterogenit v multidatabázích a
tyto popisy přeloženy do jazyka HMDL, aby mohly být rutinně využívány při definici
transformací mezi dvojicemi datových/dokumentových schémat.
Název: Gralan (Graph Language)
2001-2003
Anotace: V součinnosti s projektem INCO-Copernicus StraDiWare (Systém pro
podporu strategického plánování, jehož úkolem bylo vyvinout univerzální modelovací
nástroj UMT - Universal Modelling Tool - a ověřit jej při vytváření/modelování
informačních strategií) byl navržen a implementován obecný jazyk Gralan pro práci
s podmíněnými orientovanými pseudografy (grafy jsou spolu s kategoriemi, pravidly a
operacemi základními objekty UMT) a jeho nadstavba UMTL, což je specializovaná knihovna
pro práci s objekty UMT. Základy byly položeny při vývoji HMDL - implementace jazykových
konstrukcí HMDL využívá interní grafovou reprezentaci popisovaných objektů a vztahů
pevně danými třídami uzlů a hran, jejíž návrh byl zobecněn do návrhu Gralanu, který
podporuje práci s grafy obecných tříd uzlů a hran a mj. umožňuje strukturovaný pohled
na reprezentované objekty a práci s nimi na různé úrovni detailnosti.
Název: WWW ČKR (internetová prezentace ČKR) [VZ]
2002-2003
Anotace: Webová prezentace České konference rektorů
http://crc.muni.cz. Modelovým způsobem využívá
technologie strukturovaných uživatelských rozhraní pro prezentování informací a
principy návrhu a tvorby prezentačních systémů, v tomto případě postavených nad
datovými strukturami popsanými jazykem XML. Systematicky řeší všechny tři základní
aspekty budování prezentací - datový obsah, technickou realizaci a vzhled (grafika).
Název: Clearing MU [VZ]
2002-2004
Anotace: Systém centrálního uhrazování pohledávek a závazků mezi Masarykovou
univerzitou jako organizačním celkem a jednotlivými osobami, implementovaný v rámci
Inetu MU (viz IRIS MU výše). Řeší sdružování dat uložených v nezávislých tzv.
externích systémech do centrálního úložiště - jádra Clearingu - k dalšímu zpracování
a zpřístupnění přes jednotné prezentační rozhraní a jejich následnou zpětnou distribuci
do externích systémů. Je definováno jednotné datové rozhraní (standardní clearingová
položka, ve formátu XML) a externí systémy provádějí lokální konverze všech dat
do tohoto standardu, tj. integrovaný systém pracuje pouze se standardním datovým
schématem. Přenosy dat probíhají speciálně navrženým jednotným komunikačním protokolem
nazvaným KPC, který je asymetrický a sebezotavující a tvoří jej množina definovaných
výrazů (komunikačních slov) typu požadavky (ze strany externího systému) a odpovědi
(ze strany jádra), rovněž v syntaxi XML. KPC zajišťuje opakovaný sběr a zpětnou distribuci
dat, jejichž nezávislé zpracování může paralelně probíhat na obou stranách komunikace.
Oblast B:
Název: Certifikační autorita MU [VZ]
2002
Anotace: Zřízena a provozována základní certifikační autorita univerzity.
Pro vydávání certifikátů serverů, nacházejících se mimo správu řešitelského pracoviště,
byla vypracována certifikační politika (CP) a byl vydán tzv. Certificate Policy Statement
(CPS). Pro potřeby vydávání potenciálně velkého počtu certifikátů koncovým uživatelům
byla zprovozněna certifikační autorita na bázi volně šiřitelného software OpenCA a
byly ověřovány její funkce pro použití v rámci autentizační a autorizační infrastruktury.
Název: Centrální autentizace [VZ]
2001-2002
Anotace: Vedle rozpracovávání možností centrální autentizace pomocí
distribuovaných autentizačních a autorizačních mechanismů využívající infrastruktury
veřejných klíčů byla zavedena alternativní metoda centrální autentizace a autorizace
založená na heslech a kombinaci adresářových služeb se systémem Kerberos. Tato metoda
byla poprvé využita v projektu celouniverzitní počítačové studovny Masarykovy univerzity.
Získané zkušenosti prokázaly možnost použití této metody v masovém měřítku (počet osob
zanesených v adresářové struktuře se pohybuje v současnosti kolem 30.000).
Název: Proxy pro přístup k licencovaným informačním zdrojům [VZ]
2001
Anotace: Vlastní řešení přístupové proxy umožňující uživatelům vzdáleně
přistupujícím do sítě MU využívat "komerční" digitální knihovny (www informační
zdroje) pořízené Masarykovou univerzitou, v souladu s příslušnými licenčními
ujednáními. Identita uživatele je automaticky odvozována od jeho oprávnění
přistupovat k internímu informačnímu systému MU. Technicky je přístupová proxy
realizována kombinací dvou systémů: prvním je open source proxy server Squid,
který má povolen přístup ke všem licencovaným zdrojům a může je dále poskytovat
důvěryhodným klientům; k identifikaci důvěryhodných klientů je využíván druhý
systém - https server inet.muni.cz, který má k dispozici potřebné aktuální údaje
k autentizaci uživatelů (jména a hesla pro všech cca 30.000 studentů a 4.000
zaměstnanců resp. externích spolupracovníků MU).
Název: Server pro vzdálený přístup [VZ]
2001-2002
Anotace: Na rozdíl od předchozího systému proxy, který pracuje na aplikační
vrstvě a tudíž jsou jeho možnosti omezeny na zajištění přístupu k www informačním
zdrojům, server pro vzdálený přístup využívá nižších síťových vrstev a je tedy možné
přistupovat k informačním zdrojům nezávisle na umístění počítače nebo použitých
protokolech vyšších vrstev. Při řešení bylo využito principů virtuální privátní
sítě (VPN). Mezi klientem v nezabezpečeném externím prostředí a vstupní branou do
sítě MU je dynamicky vytvářen kryptovaný PPTP tunel mezi vnitřní sítí MU a vzdálenou
lokalitou uživatele a jeho vzdálenému konci je přidělena adresa ze sítě MU. Nad touto
konfigurací lze pak provozovat libovolnou aplikaci vyžadující přístup z vyhrazených
adres Masarykovy univerzity. Server byl integrován s autentizačními a autorizačními
mechanismy na bázi protokolů Radius a LDAP používanými v síti MU.
Název: Bezpečná komunikace medicínských aplikací [VZ]
2003
Anotace: Bezpečná infrastruktura pro komunikaci mezi metropolitním archivem
medicínských obrazových informací a připojenými nemocničními systémy. Tato komunikace
byla původně zajištěna privátní infrastrukturou na bázi ATM, avšak s nárůstem počtu
přípojných míst a změnou původních požadavků se tento systém ukázal jako nevhodný a
bylo nutné jej nahradit infrastrukturou založenou na L3 topologii a použití vyhrazených
optických tras (v rámci metropolitní sítě). Průvodním jevem této změny byla nutnost
řešit překrývající se privátní adresní prostory jednotlivých nemocnic. Problém byl
vyřešen použitím dvojitého překladu IP adres v hraničních směrovačích.
Pro komunikaci se vzdálenými (mimo-brněnskými) nemocnicemi, které není možné připojit
pomocí vyhrazeného optického vlákna, byly zkoumány technologie bezpečné komunikace
přes (veřejný) Internet. Bylo realizováno řešení využívající protokolu IPSec ve
spojení se šifrovacím zařízením Cisco PIX Firewall, které je dostatečně výkonné
pro přenos velkých objemů dat. Veškerá data jsou před vstupem na nezabezpečené
médium zašifrována a po příjmu na druhé straně spoje opět rozšifrována. K šifrování
je použito standardního algoritmu 3DES s délkou klíče 128 bitů. Souběžně byly
v praxi ověřeny obdobné, ale finančně méně náročné technologie pro připojení
mimo-nemocničních pracovišť (příslužba specialisty) a mobilních pracovních stanic.
Oblast C:
Název: Centrum a infrastruktura MeDiMed
1999-2004
Anotace: Navržena a implementována kompletní infrastruktura systému MeDiMed
(Metropolitan Digital Imaging System in Medicine) pro získávání, archivaci a zpřístupnění
digitální obrazové informace z lékařských diagnostických zařízení. Je tvořena dvěmi
centry (hlavním a záložním - každé z nich tvořeno provozními servery PACS - Picture
Archiving Communicating System, rychlým úložištěm o kapacitě 5TB zálohovaných dat,
komunikačními zařízeními a příslušným softwarovým vybavením), dlouhodobým velkokapacitním
DVD archivem 4TB (DVD jukebox s až 44*10 současně založenými médii), plně zálohovanou
optickou privátní sítí připojující brněnská nemocniční zařízení, technologiemi pro
vytvoření zabezpečného připojení mimobrněnských nemocničních zařízení přes veřejnou
počítačovou síť a technologiemi pro zabezpečené mobilní připojení.
Do systému MeDiMed je připojeno 6 velkých brněnských nemocnic, 2 mimobrněnské
nemocnice (Kyjov a Jihlava), v jednání je připojení až 10 dalších nemocnic. Jedná
se o jedinečný systém svého druhu v ČR.
Název: Digitální archív MeDiMed
2000-2004
Anotace: Archiv digitálních snímků z lékařských diagnostických zařízení
nemocnic zapojených do systému MeDiMed. V závěru roku 2004 obsahoval již 1.8 milióny
souborů ze 110 tisíc obrazových studií, o celkovém objemu 2.5 TB dat. Archiv je
optimalizován pro nepřetržitý rychlý přístup a 3-násobně zabezpečen proti ztrátě
dat (uložením na IDE disky s RAID-5, zrcadlením ve dvou vzdálených lokalitách v Brně
a vypalováním dlouhodobých dat na DVD).
Název: Výukové centrum MeDiMed
2003-2004
Anotace: Jádro specializovaného systému navrženého pro využití vybraných
anonymizovaných kolekcí dat z digitálního archivu MeDiMed pro výukové a výzkumné
účely. Je navrženo s využitím stejných technologií, které jsou používány pro praktický
provoz systému MeDiMed s cílem simulovat uživatelům reálné prostředí. Vybraná obrazová
data jsou anonymizována a doplněna o výuková metadata na bázi strukturovaného reportu
DICOM. Byly vytvořeny specializované nástroje pro realizaci dvou pilotních projektů
řešených specializovanými lékařskými týmy: Digitální atlas pozitronové emisní tomografie,
a Digitální mamografický atlas. Na výukové centrum MeDiMed je připojena specializovaná
učebna LF MU vybavená 30 prohlížeči, s cílem zahájit výuku ještě v jarním semestru 2004/2005.
4. Náklady na řešení výzkumného záměru
| Rok |
Inst. podpora ze státního rozpočtu (tis. Kč) |
Jiné zdroje (tis. Kč) |
Typ jiného zdroje (veřejné jiné než inst. podpora, tuzemské neveřejné, zahraniční) |
| 1999 |
1.033 |
1.596 |
veřejné jiné, ÚVT |
| 2000 |
2.167 |
802 |
veřejné jiné, ÚVT |
| 2001 |
2.384 |
1.499 |
ÚVT |
| 2002 |
2.505 |
839 |
ÚVT |
| 2003 |
2.697 |
2.504 |
ÚVT |
| 2004 |
2.743 |
848 |
ÚVT |
5. Čerpání finančních prostředků v roce 2004
| |
MŠMT |
ÚVT MU |
CELKEM
|
| plán |
čerpání |
čerpání |
plán |
čerpání |
| investice |
646 |
646 |
848 |
646 |
1.494 |
| neinvestice |
2.097 |
2.097 |
0 |
2.097 |
2.097 |
| celkem |
2.743 |
2.743 |
848 |
2.743 |
3.591 |
5.1 Institucionální prostředky MŠMT - čerpání
| a) investice (646) |
 |
 |
diskové pole 2.5TB Simac Techtronic pro centr.pracoviště MeDiMed |
646,0 |
 |
|
 |
celkem |
646,0 |
| |
| b) neinvestice (2.097, z toho 1.480 mzdy vč. odvodů + 617 ostatní) |
 |
 |
b1) mzdy |
 |
 |
 |
mzdy, odměny pro řešitelský tým |
1096,0 |
 |
 |
zákonné odvody z mezd a odměn |
384,0 |
 |
|
 |
 |
mzdové náklady celkem |
1480,0 |
| |
 |
b2) ostatní neinvestice |
 |
 |
 |
drobné předměty do 40.000 |
46,3 |
 |
 |
 |
notebook FSC Lifebook |
39,9 |
| brašna na notebook |
1,0 |
| autentizační biosnímač Bio Touch USB 200 (MeDiMed) |
5,4 |
|
|
 |
 |
spotřební materiál (tonery-tiskárna, papír, DVD-R media) |
15,4 |
 |
 |
náhradní díly (zapisovačka DVD-R) |
5,9 |
 |
 |
literatura (odborné knihy) |
7,1 |
 |
 |
ostatní (stipendia, doktorandi) |
36,0 |
 |
 |
ostatní (bankovní poplatky, korunová vyrovnání) |
2,4 |
 |
 |
  |
 |
 |
domácí cestovné, konf. poplatky (SOFSEM, Měřín) |
11,1 |
 |
 |
zahraniční cestovné, výzkum. pobyty, konf. poplatky |
272,6 |
 |
 |
 |
CNR Pisa (Zezula) |
28,0 |
| ELMAR'04, Chorvatsko (Dostál, Petrenko) |
47,4 |
| EDBT'04, Řecko (Kohoutková, část) |
11,5 |
| EuroPACS 2004, Itálie (Dostál) |
46,5 |
| DELOS letní škola, Itálie (Kovář, Krejčíř) |
54,4 |
| ECDL 04 - WebArchiving Wrksp, UK (Žabička) |
8,9 |
| VLDB 04, Kanada (Zezula) |
75,9 |
|
|
 |
 |
režie pracoviště (příspěvek na energie, telefony) |
220,0 |
 |
|
 |
 |
ostatní neinvestice celkem |
617,0 |
5.2 ÚVT - přidružené aktivity
| a) investice |
 |
 |
doplatek diskového pole (ÚVT) |
3,4 |
| diskové pole 3TB pro záložní pracoviště MeDiMed (ÚVT) |
679,6 |
| 2x mobilní stanice + čtečky biometr.dat a čipových karet (ÚVT) |
164,7 |
|
| celkem |
847,7 |
V oblasti kapitálových prostředků (investic) byla v roce 2004 pořízena dvě disková
pole 2.5TB resp. 3TB pro hlavní a záložní centrum MeDiMed, pro rozšíření velkokapacitních
datových úložišť sloužících pro rychlé zpřístupnění obrazové informace. Obě pracoviště
MeDiMed nyní disponují úložnou kapacitou 5TB zálohovaných dat.
Čerpání v oblasti neinvestic bylo ze 70.5% tvořeno mzdovými náklady pro řešitelský
tým (jeho složení je uvedeno v dílčí zprávě za rok 2004), 13,5% nákladů tvořil
příspěvek na zahraniční cesty členů řešitelského týmu (řešitelé prezentovali výsledky
VZ na celkem 21 konferencí, z toho 12 v zahraničí; jen část těchto nákladů byla hrazena
z výzkumného záměru), 10.5% nákladů představovala režie řešitelského pracoviště. Zbylých
6% neinvestičních nákladů tvořil spotřební materiál, literatura, drobné předměty do 40.000 Kč aj.
Z vlastních prostředků řešitelského pracoviště byly pořízeny dvě mobilní stanice pro
ověřování možností a podmínek bezpečného přístupu mobilních uživatelů do datového centra
MeDiMed a technologií pro zabezpečení dat na mobilních stanicích (biometrické snímače
a snímače čipových karet).
V Brně dne 14.ledna 2005
| RNDr. Miroslav Bartošek, CSc. |
|
řešitel |
|
|
 |